26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5186 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  611  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  75.11 
 
 		 322 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  64.26 
 
 		 299 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  70.78 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  63.89 
 
 		 296 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  59.93 
 
 		 307 aa  338  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  59.39 
 
 		 305 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  31.15 
 
 		 417 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  28.8 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  31.65 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  28.24 
 
 		 560 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  32.54 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  28.28 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  31.45 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  26.69 
 
 		 566 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  30.05 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  29.38 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  29.69 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  25.27 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  27.6 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  27.6 
 
 		 240 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  26.4 
 
 		 268 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  32.05 
 
 		 258 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  28.97 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  34.07 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  22.84 
 
 		 407 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>