28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1327 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  616  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  74.07 
 
 		 307 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  60.19 
 
 		 322 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  62.59 
 
 		 296 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  58.77 
 
 		 299 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  59.39 
 
 		 301 aa  325  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  57.05 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  31.5 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  29.9 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  30.29 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  30.57 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  27.72 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  35.21 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  29.95 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  29.24 
 
 		 560 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  29.47 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  29.05 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  28.88 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  32.89 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  35.21 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  27.09 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  28.49 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  28.49 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  28.16 
 
 		 437 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  23.58 
 
 		 407 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  29.84 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  30.95 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  27.56 
 
 		 358 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>