29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5203 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  820    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  36.5 
 
 		 560 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  34.46 
 
 		 566 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  29.95 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  27.23 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  29.95 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  26.01 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  25.79 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  25.43 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  25.64 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  24.55 
 
 		 233 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  24.47 
 
 		 258 aa  53.1  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  24.37 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  24.37 
 
 		 240 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  22.4 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  22.17 
 
 		 273 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  23.53 
 
 		 290 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  24.88 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  22.22 
 
 		 273 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  23.63 
 
 		 307 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  22.84 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  22.22 
 
 		 306 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  46.15 
 
 		 279 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  46.15 
 
 		 279 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  34.62 
 
 		 280 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  25 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  43.48 
 
 		 280 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  41.3 
 
 		 280 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>