More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2068 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  100 
 
 		 279 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  99.64 
 
 		 279 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  71.79 
 
 		 280 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  71.79 
 
 		 280 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  62.03 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  55.51 
 
 		 287 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  53.41 
 
 		 280 aa  255  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  53.7 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  55.76 
 
 		 282 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  48.94 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  47.54 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  50.35 
 
 		 280 aa  241  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  49.82 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  44.96 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  46.47 
 
 		 651 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  46.47 
 
 		 651 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  46.47 
 
 		 1156 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  45.35 
 
 		 652 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  41.46 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  41.46 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  44.81 
 
 		 361 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  43.67 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  42.24 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  39.15 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  39.15 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  45.83 
 
 		 244 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  43.11 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  40.46 
 
 		 689 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  33.83 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  37.5 
 
 		 668 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  38.85 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  37.5 
 
 		 671 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  37.5 
 
 		 669 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  37.04 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  38.01 
 
 		 684 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  38.01 
 
 		 684 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  38.01 
 
 		 683 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  39.58 
 
 		 620 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  36.13 
 
 		 247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  37.18 
 
 		 640 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  45.04 
 
 		 179 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  37.5 
 
 		 351 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  29.76 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  38.46 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  44.52 
 
 		 684 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  42.77 
 
 		 688 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  36.65 
 
 		 674 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  39.88 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  36.05 
 
 		 243 aa  99  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  35.48 
 
 		 197 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  36.94 
 
 		 229 aa  97.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  32.99 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  32.5 
 
 		 387 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  34.64 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  32.82 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  35.79 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  35.79 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  41.35 
 
 		 226 aa  93.2  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  37.06 
 
 		 381 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  37.42 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  33.99 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  33.99 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  32.03 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  32.63 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  34.36 
 
 		 656 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  31.21 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  36.75 
 
 		 564 aa  85.5  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  33.92 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  36.75 
 
 		 641 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  34.32 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  32.2 
 
 		 667 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  36.05 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  39.08 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  40.26 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3465  hypothetical protein  48.53 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  33.73 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  33.58 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  31.62 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  31.55 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2407  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.71 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428709  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2151  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.85 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.58 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2312  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  28.68 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1088  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.35 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.850787  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0389  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.11 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  29.05 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  28.15 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1294  Endopeptidase Clp  29.93 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1706  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.89 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2382  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  26.12 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.656103  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2030  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  26.12 
 
 		 227 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162468  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.06 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.06 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.06 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  29.17 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  28.36 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0389  peptidase S14, ClpP  25.37 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0601848  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0405  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  26.12 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1837  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  27.94 
 
 		 226 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.54 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>