More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3249 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  54.19 
 
 		 651 aa  714    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  72.84 
 
 		 640 aa  957    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  72.77 
 
 		 669 aa  982    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  54.19 
 
 		 651 aa  714    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 667 aa  1378    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  72.51 
 
 		 668 aa  968    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  51.79 
 
 		 684 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  53.21 
 
 		 652 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  51.79 
 
 		 684 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  51.64 
 
 		 683 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  52.96 
 
 		 689 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  73.87 
 
 		 656 aa  1012    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  53.6 
 
 		 1156 aa  717    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  63.61 
 
 		 671 aa  838    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  41.87 
 
 		 620 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  41.89 
 
 		 674 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  39.97 
 
 		 684 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  32.09 
 
 		 641 aa  273  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  30.74 
 
 		 688 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  35.53 
 
 		 600 aa  212  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  37.65 
 
 		 687 aa  209  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  33.97 
 
 		 696 aa  206  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  32.76 
 
 		 689 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  32.88 
 
 		 586 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  32.87 
 
 		 624 aa  182  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  30.41 
 
 		 693 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  30.03 
 
 		 599 aa  160  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  36.82 
 
 		 257 aa  154  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  36.82 
 
 		 257 aa  154  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  31.45 
 
 		 391 aa  133  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  35.45 
 
 		 251 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  35.45 
 
 		 251 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  35.45 
 
 		 251 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  38.1 
 
 		 258 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  35.24 
 
 		 227 aa  128  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  31.52 
 
 		 612 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  35.29 
 
 		 381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  30.29 
 
 		 387 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  34.29 
 
 		 247 aa  113  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  40.12 
 
 		 248 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  35.24 
 
 		 247 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  36.33 
 
 		 365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  42.14 
 
 		 197 aa  112  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  27.43 
 
 		 1179 aa  110  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  35.75 
 
 		 247 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  32.52 
 
 		 230 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  29.01 
 
 		 623 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  28.7 
 
 		 383 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  35.96 
 
 		 564 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  35.32 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  29.04 
 
 		 780 aa  102  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  34.81 
 
 		 282 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  35.18 
 
 		 216 aa  102  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  30.97 
 
 		 287 aa  101  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  28.38 
 
 		 780 aa  100  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  33.71 
 
 		 280 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  38.22 
 
 		 280 aa  98.2  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  38.22 
 
 		 280 aa  98.2  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  28.83 
 
 		 770 aa  97.8  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  38.41 
 
 		 237 aa  94  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  30.8 
 
 		 280 aa  91.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  38.28 
 
 		 242 aa  90.5  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  30.2 
 
 		 280 aa  88.6  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  35.33 
 
 		 247 aa  88.2  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  32.11 
 
 		 284 aa  87.4  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  34.83 
 
 		 284 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  35.95 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  32.7 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  31.53 
 
 		 229 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  31.53 
 
 		 229 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  34.12 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  28.09 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1785  hypothetical protein  26.85 
 
 		 591 aa  80.1  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  33.09 
 
 		 234 aa  80.1  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  32.91 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  41.35 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  34.62 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  34.3 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  29.87 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  31.29 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  36.84 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0436  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.52 
 
 		 194 aa  68.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1845  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  33.09 
 
 		 198 aa  68.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000342072  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1260  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  35.56 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0553999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  30.67 
 
 		 260 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2740  endopeptidase Clp  34.25 
 
 		 206 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600762  decreased coverage  0.00246808 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  33.58 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2206  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.31 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  32.76 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0809  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.33 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.76 
 
 		 235 aa  65.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0793  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.33 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1109  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.11 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.42074  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3411  hypothetical protein  30.94 
 
 		 178 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.57 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  32.77 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  34.88 
 
 		 226 aa  63.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3324  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.03 
 
 		 212 aa  63.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.09384 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  32.2 
 
 		 279 aa  63.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1169  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.27 
 
 		 210 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>