More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0783 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  57.52 
 
 
651 aa  763    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  57.52 
 
 
651 aa  763    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  56.53 
 
 
652 aa  744    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  95.54 
 
 
668 aa  1291    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  55.67 
 
 
684 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  95.5 
 
 
640 aa  1235    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  72.16 
 
 
667 aa  960    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  55.67 
 
 
684 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  63.77 
 
 
656 aa  835    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  55.82 
 
 
683 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  57.82 
 
 
689 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  100 
 
 
669 aa  1384    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  57.01 
 
 
1156 aa  768    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  82.07 
 
 
671 aa  1099    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  45.09 
 
 
620 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  40.38 
 
 
674 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  41.14 
 
 
684 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  31.89 
 
 
688 aa  269  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  29.84 
 
 
641 aa  259  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  36.5 
 
 
687 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  34.62 
 
 
696 aa  204  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  34.38 
 
 
600 aa  204  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  31.28 
 
 
586 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  35.69 
 
 
689 aa  178  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  31.5 
 
 
693 aa  175  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  30.25 
 
 
624 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  41.33 
 
 
361 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  42.86 
 
 
227 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  39.34 
 
 
564 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  29.1 
 
 
599 aa  153  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  44.09 
 
 
237 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  38.7 
 
 
381 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  40.59 
 
 
257 aa  150  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  40.59 
 
 
257 aa  150  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  42.05 
 
 
216 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  39.27 
 
 
251 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  36.76 
 
 
387 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  43.02 
 
 
247 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  38.36 
 
 
251 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  38.36 
 
 
251 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  38.92 
 
 
345 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  38.18 
 
 
230 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  36.86 
 
 
365 aa  136  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  48.32 
 
 
258 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  33.07 
 
 
383 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  30.99 
 
 
391 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  47.01 
 
 
197 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  40.65 
 
 
282 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  41.18 
 
 
280 aa  124  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  41.18 
 
 
280 aa  124  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  39.26 
 
 
280 aa  124  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  35.68 
 
 
248 aa  124  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  30.95 
 
 
612 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  37.37 
 
 
247 aa  123  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  35.68 
 
 
247 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  37.99 
 
 
287 aa  122  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  47.69 
 
 
242 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  37.85 
 
 
280 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  42.04 
 
 
229 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  42.04 
 
 
229 aa  119  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  37.95 
 
 
281 aa  118  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  35.29 
 
 
280 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  23.17 
 
 
1179 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  39.75 
 
 
243 aa  114  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  42.97 
 
 
247 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  40.38 
 
 
244 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  38.46 
 
 
284 aa  108  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  30.94 
 
 
351 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  39.29 
 
 
179 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  37.33 
 
 
234 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  34.34 
 
 
284 aa  102  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  37.7 
 
 
260 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  35.14 
 
 
279 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  46.15 
 
 
226 aa  101  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  35.14 
 
 
279 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  39.01 
 
 
242 aa  100  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  34.34 
 
 
284 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  28.66 
 
 
780 aa  97.8  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  26.46 
 
 
623 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  27.69 
 
 
780 aa  94.7  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  36.02 
 
 
260 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  27.91 
 
 
770 aa  91.7  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  34.78 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  32.91 
 
 
243 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1785  hypothetical protein  26.99 
 
 
591 aa  77.8  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  31.82 
 
 
300 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  36.99 
 
 
223 aa  76.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  27.3 
 
 
382 aa  77  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  34.33 
 
 
214 aa  72.8  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  32.84 
 
 
211 aa  72  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  35.04 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  36.84 
 
 
245 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  36.84 
 
 
245 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  33.61 
 
 
229 aa  70.1  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2052  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.06 
 
 
201 aa  66.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.913784  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.67 
 
 
228 aa  65.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1109  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.67 
 
 
209 aa  65.1  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.42074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  32.33 
 
 
210 aa  65.1  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  34.03 
 
 
208 aa  64.7  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  34.88 
 
 
203 aa  64.7  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>