More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1304 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  100 
 
 		 260 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  35.45 
 
 		 651 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  35.26 
 
 		 1156 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  35.45 
 
 		 651 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  39.29 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  35.39 
 
 		 689 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  36.02 
 
 		 668 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  36.02 
 
 		 671 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  36.02 
 
 		 640 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  36.02 
 
 		 669 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  32.51 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  31.44 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  33.54 
 
 		 684 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  33.54 
 
 		 684 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  33.54 
 
 		 683 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  34.59 
 
 		 652 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  34.7 
 
 		 564 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  33.16 
 
 		 227 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  33.33 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  34.23 
 
 		 216 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  30.81 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  32.85 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  40.11 
 
 		 361 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  34.33 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  32.47 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  35.68 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  31.79 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  32 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  32 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  35.33 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  32.47 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  35.46 
 
 		 620 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  32.45 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  25.56 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  28.25 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  28.25 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.46 
 
 		 381 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  33.88 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  29.95 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  29.17 
 
 		 656 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  35.44 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  36.13 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  35.06 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  35.06 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  34.87 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  35.44 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  29.09 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  27.89 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  27.78 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  27.89 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  33.72 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  29.76 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  31.25 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  30.06 
 
 		 667 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  33.58 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  26.27 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  34.15 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  34.96 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  30.72 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3662  endopeptidase Clp  32.67 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1476  endopeptidase Clp  32.3 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.219391  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  30.43 
 
 		 641 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  32.85 
 
 		 674 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  29.23 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  31.25 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.85 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.76 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3828  endopeptidase Clp  32.89 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0167081  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2956  endopeptidase Clp  29.48 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152745  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  31.33 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  31.65 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2913  Endopeptidase Clp  27.67 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2166  Endopeptidase Clp  34 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.67 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  31.41 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1088  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  33.55 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.850787  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1109  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.67 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.42074  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.27 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3132  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  31.13 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2206  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.67 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  29.14 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0710  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.57 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3404  endopeptidase Clp  32 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_617  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit  30.57 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0489  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.77 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.148245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0645  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.57 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0319  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.1 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02985  Protease subunit of ATP-dependent Clp protease  30.67 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000129088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1305  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.33 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2407  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.68 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1553  endopeptidase Clp  32 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3424  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.67 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  30.26 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00691  Clp protease proteolytic subunit  30.2 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176795 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1247  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.33 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.063421 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.19 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  33.51 
 
 		 684 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.33 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  32.76 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  31.79 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>