More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2853 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  100 
 
 		 564 aa  1146    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  46.07 
 
 		 1156 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  39.81 
 
 		 668 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  39.34 
 
 		 671 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  39.34 
 
 		 669 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  41.46 
 
 		 651 aa  148  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  41.46 
 
 		 651 aa  148  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  42.86 
 
 		 684 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  42.86 
 
 		 684 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  42.29 
 
 		 683 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  39.49 
 
 		 640 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  37.9 
 
 		 652 aa  140  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  40.45 
 
 		 689 aa  140  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  38.86 
 
 		 237 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  41.21 
 
 		 227 aa  133  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  35.59 
 
 		 216 aa  127  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  38.68 
 
 		 361 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  35.37 
 
 		 257 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  35.37 
 
 		 257 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  39.55 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  31.45 
 
 		 251 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  31.45 
 
 		 251 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  31.45 
 
 		 251 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  34.08 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  38.29 
 
 		 280 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  41.84 
 
 		 620 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  40.91 
 
 		 688 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  38.51 
 
 		 287 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  35.96 
 
 		 667 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  41.4 
 
 		 351 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  32.97 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  40.61 
 
 		 280 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  36.63 
 
 		 656 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  36.65 
 
 		 345 aa  101  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  33.99 
 
 		 247 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  39.64 
 
 		 282 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  39.77 
 
 		 242 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  33.86 
 
 		 365 aa  98.2  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  39.49 
 
 		 280 aa  95.9  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  37.98 
 
 		 400 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  36.43 
 
 		 258 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  40.44 
 
 		 197 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  37.93 
 
 		 247 aa  94  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  33.17 
 
 		 674 aa  93.6  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  35.62 
 
 		 243 aa  93.2  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  35.91 
 
 		 280 aa  91.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  35.91 
 
 		 280 aa  91.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  36.25 
 
 		 641 aa  90.9  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  43.92 
 
 		 281 aa  89  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  28.9 
 
 		 230 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  38.19 
 
 		 229 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  38.19 
 
 		 229 aa  87.4  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  32.56 
 
 		 248 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  33.72 
 
 		 247 aa  87  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  34.7 
 
 		 260 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  39.05 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  32.56 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  34.87 
 
 		 244 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  34.69 
 
 		 179 aa  82  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  38.24 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  33.12 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  32.5 
 
 		 284 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  35.32 
 
 		 684 aa  78.2  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  27.74 
 
 		 234 aa  76.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0787  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.78 
 
 		 203 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6060  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.69 
 
 		 203 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  35.53 
 
 		 226 aa  72  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  38.89 
 
 		 223 aa  72  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  34.07 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2052  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.43 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.913784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  35.76 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  32.69 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  35.76 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3078  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.11 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01350  conserved hypothetical protein  29.71 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00166627  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.34 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2742  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.36 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  34.13 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.3 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3642  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  32.65 
 
 		 202 aa  67  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.349726  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  34.51 
 
 		 242 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2151  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.56 
 
 		 200 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0593  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35.15 
 
 		 218 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15461  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.11 
 
 		 197 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.614772 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28390  protease subunit of ATP-dependent protease  35.38 
 
 		 197 aa  66.6  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  36.75 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  36.75 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1554  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.08 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.242253  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.45 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.81 
 
 		 198 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1978  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.29 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0100238 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  35.29 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.26 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1059  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.87 
 
 		 197 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  31.36 
 
 		 216 aa  63.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2956  endopeptidase Clp  33.82 
 
 		 197 aa  63.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.28 
 
 		 202 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2790  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.08 
 
 		 202 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.29 
 
 		 196 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0917  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.59 
 
 		 211 aa  62  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>