More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0626 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  100 
 
 
244 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  53.01 
 
 
247 aa  246  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  49.3 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  53.67 
 
 
229 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  53.67 
 
 
229 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  45.99 
 
 
226 aa  167  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  46.25 
 
 
242 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  43.12 
 
 
243 aa  152  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  42.29 
 
 
260 aa  144  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  40.29 
 
 
229 aa  139  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  55.83 
 
 
300 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  43.27 
 
 
361 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  36.11 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  44.44 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  38 
 
 
245 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  38 
 
 
245 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  46.5 
 
 
280 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  46.5 
 
 
280 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  39.05 
 
 
258 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  36.33 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  47.01 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  41.1 
 
 
280 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  45.21 
 
 
365 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  44.78 
 
 
287 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  39.68 
 
 
689 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  39.77 
 
 
1156 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  41.36 
 
 
651 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  41.36 
 
 
651 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  38.89 
 
 
179 aa  118  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  44.08 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  39.51 
 
 
652 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  39.15 
 
 
683 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  39.15 
 
 
684 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  39.15 
 
 
684 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  42.11 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  33.48 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  42.96 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  37.19 
 
 
674 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  36.52 
 
 
620 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  39.29 
 
 
668 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  40.38 
 
 
671 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  39.29 
 
 
669 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  39.22 
 
 
247 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  40.52 
 
 
640 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  43.8 
 
 
284 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  45.11 
 
 
284 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  36.46 
 
 
257 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  36.46 
 
 
257 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  37.04 
 
 
237 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  43.88 
 
 
197 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  42 
 
 
281 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  45.83 
 
 
279 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  39.07 
 
 
247 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  45.14 
 
 
279 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  38.41 
 
 
247 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  38.41 
 
 
248 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  40.8 
 
 
351 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  34.47 
 
 
251 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  36.71 
 
 
251 aa  98.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  36.71 
 
 
251 aa  98.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  42.28 
 
 
284 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  36.84 
 
 
688 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  35 
 
 
381 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  32.56 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  32.14 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  32.91 
 
 
387 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  30.46 
 
 
383 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  36.02 
 
 
656 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  32.28 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  34.87 
 
 
564 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  37.36 
 
 
684 aa  81.6  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  34.12 
 
 
667 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  37.21 
 
 
641 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  34.16 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  36.92 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.08 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.31 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.6 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04370  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 2  32.33 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08441  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.5 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0799239  hitchhiker  0.00187741 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  30.43 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3785  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  31.85 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0806419  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1978  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.57 
 
 
197 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0100238 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08021  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.79 
 
 
195 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.07 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  30.83 
 
 
203 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.57 
 
 
211 aa  63.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1088  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.33 
 
 
194 aa  63.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.850787  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08031  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.79 
 
 
195 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1440  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.32 
 
 
218 aa  62  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.53484  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01417  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.83 
 
 
208 aa  62  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1180  hypothetical protein  29.32 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.222987 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1260  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  30.37 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0553999  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2913  Endopeptidase Clp  27.41 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0615  Endopeptidase Clp  30.94 
 
 
202 aa  61.2  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0446476  normal  0.853287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.43 
 
 
198 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  29.32 
 
 
213 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1294  Endopeptidase Clp  28.99 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0910  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.32 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1554  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.08 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.242253  normal  0.191867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>