More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0756 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  84.91 
 
 
640 aa  1103    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  81.6 
 
 
669 aa  1110    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  52.83 
 
 
684 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  55.02 
 
 
651 aa  722    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  54.64 
 
 
1156 aa  726    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  52.83 
 
 
684 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  100 
 
 
671 aa  1384    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  63.01 
 
 
667 aa  816    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  52.91 
 
 
683 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  54.75 
 
 
652 aa  687    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  66.16 
 
 
656 aa  866    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  55.02 
 
 
651 aa  722    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  85.39 
 
 
668 aa  1160    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  55.07 
 
 
689 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  44.77 
 
 
620 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  39.94 
 
 
674 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  39.94 
 
 
684 aa  362  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  31.2 
 
 
688 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  28.46 
 
 
641 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  36.32 
 
 
696 aa  201  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  37.13 
 
 
687 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  34.19 
 
 
600 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  33.92 
 
 
586 aa  183  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  34.66 
 
 
689 aa  173  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  41.07 
 
 
361 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  42.86 
 
 
227 aa  163  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  29.53 
 
 
624 aa  161  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  30.08 
 
 
693 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  39.34 
 
 
564 aa  153  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  44.09 
 
 
237 aa  151  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  38.94 
 
 
381 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  40.59 
 
 
257 aa  150  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  40.59 
 
 
257 aa  150  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  42.05 
 
 
216 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  38.12 
 
 
251 aa  142  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  36.48 
 
 
387 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  43.02 
 
 
247 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  37.67 
 
 
251 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  37.67 
 
 
251 aa  140  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  37 
 
 
345 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  48.32 
 
 
258 aa  134  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  37.04 
 
 
365 aa  134  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  37.79 
 
 
230 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  29.71 
 
 
391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  27.09 
 
 
599 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  33.33 
 
 
383 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  36.62 
 
 
247 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  44.22 
 
 
197 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  34.82 
 
 
282 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  41.18 
 
 
280 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  41.18 
 
 
280 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  36.67 
 
 
248 aa  124  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  38.82 
 
 
280 aa  124  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  36.67 
 
 
247 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  37.99 
 
 
287 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  47.69 
 
 
242 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  37.85 
 
 
280 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  42.04 
 
 
229 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  37.95 
 
 
281 aa  119  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  42.04 
 
 
229 aa  119  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  36.57 
 
 
280 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  39.75 
 
 
243 aa  114  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  26.41 
 
 
1179 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  42.97 
 
 
247 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  40.38 
 
 
244 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  35.03 
 
 
284 aa  108  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  37.33 
 
 
234 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  27.22 
 
 
612 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  37.7 
 
 
260 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  39.29 
 
 
179 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  34.34 
 
 
284 aa  102  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  46.15 
 
 
226 aa  101  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  39.01 
 
 
242 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  26.46 
 
 
623 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  34.34 
 
 
284 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  30.84 
 
 
351 aa  99.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  37.5 
 
 
279 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  37.5 
 
 
279 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  36.02 
 
 
260 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  27.07 
 
 
780 aa  90.5  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  26.8 
 
 
780 aa  89  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  34.78 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  31.75 
 
 
243 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  30.85 
 
 
770 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  36.99 
 
 
223 aa  76.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  39.24 
 
 
300 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  34.33 
 
 
214 aa  72.4  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  32.84 
 
 
211 aa  72  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  31.92 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  36.84 
 
 
245 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  36.84 
 
 
245 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  33.61 
 
 
229 aa  70.1  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1785  hypothetical protein  24.77 
 
 
591 aa  67  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2052  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.06 
 
 
201 aa  66.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.913784  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.67 
 
 
228 aa  65.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1109  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.67 
 
 
209 aa  65.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.42074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  32.33 
 
 
210 aa  65.1  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  34.03 
 
 
208 aa  64.7  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  34.88 
 
 
203 aa  64.3  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1978  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.58 
 
 
197 aa  64.3  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0100238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>