240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6597 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 684 aa  1383    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  41.14 
 
 		 668 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  41.3 
 
 		 640 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  40.85 
 
 		 669 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  42.54 
 
 		 674 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  39.94 
 
 		 651 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  39.8 
 
 		 1156 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  39.94 
 
 		 651 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  39.97 
 
 		 671 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  38.23 
 
 		 689 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  39.83 
 
 		 667 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  38.36 
 
 		 652 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  37.55 
 
 		 684 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  37.55 
 
 		 684 aa  365  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  36.64 
 
 		 683 aa  362  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  36.32 
 
 		 656 aa  352  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  33.24 
 
 		 688 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  45.36 
 
 		 620 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  37.01 
 
 		 687 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  40.8 
 
 		 641 aa  232  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  36.96 
 
 		 696 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  35.5 
 
 		 600 aa  213  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  35.01 
 
 		 689 aa  200  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  32.94 
 
 		 693 aa  186  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  28.57 
 
 		 624 aa  168  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  50.27 
 
 		 351 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  31.05 
 
 		 586 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  31.23 
 
 		 599 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  30.24 
 
 		 612 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  45.02 
 
 		 400 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  30.23 
 
 		 391 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  28.05 
 
 		 1179 aa  127  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  41.67 
 
 		 287 aa  125  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  43.56 
 
 		 280 aa  123  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  37.97 
 
 		 216 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  39.18 
 
 		 280 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  39.18 
 
 		 280 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  30.94 
 
 		 780 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  43.79 
 
 		 280 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  43.29 
 
 		 280 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  34.7 
 
 		 257 aa  118  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  34.7 
 
 		 257 aa  118  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  43.64 
 
 		 247 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  29.97 
 
 		 780 aa  114  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  42.42 
 
 		 248 aa  114  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  37.97 
 
 		 227 aa  113  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  42.42 
 
 		 247 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  38.01 
 
 		 242 aa  111  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  46.15 
 
 		 179 aa  110  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  39.63 
 
 		 247 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  38.75 
 
 		 229 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  38.75 
 
 		 229 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  38.1 
 
 		 282 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  40.74 
 
 		 361 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  44.52 
 
 		 279 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  34.76 
 
 		 237 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  42.41 
 
 		 281 aa  104  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  44.52 
 
 		 279 aa  105  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  36.75 
 
 		 234 aa  104  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  27.68 
 
 		 770 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  38.75 
 
 		 243 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  36.36 
 
 		 247 aa  103  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  34.03 
 
 		 230 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  45.21 
 
 		 282 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  45.1 
 
 		 245 aa  98.6  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  37.36 
 
 		 244 aa  98.2  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  45.1 
 
 		 245 aa  98.6  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  40.85 
 
 		 284 aa  98.2  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  35.53 
 
 		 564 aa  97.8  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  28.1 
 
 		 623 aa  96.3  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  31.63 
 
 		 260 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  38.76 
 
 		 258 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  32.65 
 
 		 251 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  35.92 
 
 		 197 aa  92  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  26.99 
 
 		 382 aa  90.9  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  36.24 
 
 		 243 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  33.5 
 
 		 251 aa  89.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  33.5 
 
 		 251 aa  89.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  34.88 
 
 		 381 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  39.13 
 
 		 242 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  35.4 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  37.3 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  35.4 
 
 		 284 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  36.97 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  32.93 
 
 		 387 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  31.9 
 
 		 229 aa  78.6  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  32.69 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  31.68 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1785  hypothetical protein  25.91 
 
 		 591 aa  73.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  31.48 
 
 		 223 aa  70.1  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  32.78 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3411  hypothetical protein  28.89 
 
 		 178 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.53 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1169  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.08 
 
 		 210 aa  60.1  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.56 
 
 		 198 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  29.2 
 
 		 211 aa  59.3  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3410  hypothetical protein  30.77 
 
 		 601 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.56 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1305  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.15 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  30.25 
 
 		 479 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>