45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2821 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  100 
 
 		 599 aa  1199    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  49.5 
 
 		 586 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  39.46 
 
 		 624 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  37.72 
 
 		 600 aa  364  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  36.2 
 
 		 689 aa  317  4e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  35.55 
 
 		 687 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  33.18 
 
 		 1179 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  41.98 
 
 		 696 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  30.86 
 
 		 623 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  37.04 
 
 		 641 aa  209  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  30.34 
 
 		 612 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  35.54 
 
 		 693 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  28.37 
 
 		 667 aa  164  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  30.24 
 
 		 651 aa  161  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  30.24 
 
 		 651 aa  161  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  30.24 
 
 		 1156 aa  160  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  31.14 
 
 		 684 aa  157  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  27.68 
 
 		 669 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  28.85 
 
 		 689 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  26.62 
 
 		 640 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  26.62 
 
 		 668 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  35.16 
 
 		 688 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1785  hypothetical protein  28.34 
 
 		 591 aa  154  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  29.88 
 
 		 684 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  29.88 
 
 		 684 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  29.88 
 
 		 683 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  30.26 
 
 		 652 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  26.87 
 
 		 656 aa  144  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  30.84 
 
 		 620 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  33.44 
 
 		 391 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  30.86 
 
 		 674 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  25.99 
 
 		 671 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  32.23 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  50 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1157  peptidase U35 phage prohead HK97  43.9 
 
 		 286 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  28.82 
 
 		 780 aa  91.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1299  peptidase U35, phage prohead HK97  41.1 
 
 		 663 aa  88.6  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  27.78 
 
 		 780 aa  87.8  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  41.1 
 
 		 624 aa  75.1  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  41.1 
 
 		 624 aa  75.1  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  38.46 
 
 		 624 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  38.46 
 
 		 624 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  26.17 
 
 		 770 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1962  major head subunit protein  26.38 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.248362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3411  hypothetical protein  30.41 
 
 		 178 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>