More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3866 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  100 
 
 
280 aa  558  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  91.43 
 
 
280 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  72.95 
 
 
280 aa  398  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  50 
 
 
280 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  50 
 
 
280 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  50.18 
 
 
282 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  49.62 
 
 
284 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  50.71 
 
 
279 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  50.35 
 
 
279 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  49.29 
 
 
282 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  49.08 
 
 
284 aa  225  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  46.92 
 
 
287 aa  221  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  49.12 
 
 
281 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  50 
 
 
284 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  43.12 
 
 
216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  41.03 
 
 
237 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  43.75 
 
 
651 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  43.75 
 
 
651 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  43.75 
 
 
1156 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  39.88 
 
 
227 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  43.12 
 
 
652 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  37.23 
 
 
668 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  42.14 
 
 
257 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  42.14 
 
 
257 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  40 
 
 
689 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  37.23 
 
 
671 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  37.23 
 
 
669 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  38.29 
 
 
640 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  41.4 
 
 
620 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  44.08 
 
 
244 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  42.95 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  42.95 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  38.46 
 
 
684 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  38.46 
 
 
684 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  37.87 
 
 
683 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  39.88 
 
 
674 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  32.34 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  41.78 
 
 
247 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  44.71 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  36.02 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  40.94 
 
 
242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  40.99 
 
 
688 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  40.13 
 
 
351 aa  109  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  41.06 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  37.65 
 
 
247 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  36.31 
 
 
248 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  33.48 
 
 
247 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  43.79 
 
 
684 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  37.5 
 
 
251 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  32.77 
 
 
234 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  41.83 
 
 
242 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  38.06 
 
 
243 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  38.15 
 
 
345 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  43.09 
 
 
197 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  39.39 
 
 
564 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  36.84 
 
 
251 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  36.84 
 
 
251 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  33.33 
 
 
656 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3465  hypothetical protein  69.57 
 
 
140 aa  95.5  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286373  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  39.55 
 
 
179 aa  94  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  36 
 
 
243 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  31.29 
 
 
230 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  35.19 
 
 
667 aa  92.8  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  40.27 
 
 
226 aa  92  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  46.56 
 
 
245 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  35.59 
 
 
229 aa  91.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  46.56 
 
 
245 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  39.49 
 
 
641 aa  85.5  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  35.54 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  35 
 
 
381 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  43.7 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  30.58 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  33.53 
 
 
223 aa  77  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  33.96 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  33.88 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.23 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  31.85 
 
 
200 aa  63.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2151  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.12 
 
 
200 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  32.81 
 
 
219 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  38.1 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.3 
 
 
200 aa  60.1  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0908  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.2 
 
 
209 aa  60.1  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.78 
 
 
235 aa  59.3  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0934  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  27.74 
 
 
209 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.593149  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  27.15 
 
 
211 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6060  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.69 
 
 
203 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353257  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.26 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08021  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.22 
 
 
195 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0750  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.22 
 
 
195 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08031  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.22 
 
 
195 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  30.26 
 
 
211 aa  55.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0787  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30 
 
 
203 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  27.41 
 
 
214 aa  56.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08421  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.16 
 
 
196 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1247  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.5 
 
 
196 aa  55.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.063421 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1672  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25 
 
 
197 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.122412  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  23.81 
 
 
216 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2790  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.24 
 
 
202 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1531  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.46 
 
 
208 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3078  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.46 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>