24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3465 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3465  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  280  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  72.86 
 
 		 280 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  64.38 
 
 		 280 aa  95.9  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  69.57 
 
 		 280 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  50 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  45.71 
 
 		 287 aa  67.8  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  48.53 
 
 		 279 aa  67.4  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  46.27 
 
 		 282 aa  67.4  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  44.93 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  44.93 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  35.51 
 
 		 282 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  44.78 
 
 		 284 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  31.62 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  41.79 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  35.38 
 
 		 244 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  30.77 
 
 		 242 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  32.39 
 
 		 260 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  36.84 
 
 		 284 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  28.38 
 
 		 668 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  38.33 
 
 		 229 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  28.38 
 
 		 640 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  28.38 
 
 		 671 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  28.38 
 
 		 669 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  30.16 
 
 		 242 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>