More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4464 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  100 
 
 		 282 aa  570  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  58.19 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  53.74 
 
 		 282 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  51.85 
 
 		 280 aa  266  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  53.11 
 
 		 280 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  53.11 
 
 		 280 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  50.71 
 
 		 280 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  56.44 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  56.44 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  52.5 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  49.29 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  51.67 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  48.72 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  45.02 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  37.68 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  43.03 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  44.44 
 
 		 229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  42.5 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  42.07 
 
 		 351 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  38.42 
 
 		 361 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  33.33 
 
 		 243 aa  116  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  35.63 
 
 		 651 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  36.47 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  35.63 
 
 		 1156 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  36.47 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  35.63 
 
 		 651 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  32.56 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  36.94 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  38.73 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  29.03 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  35 
 
 		 674 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  34.48 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  29.65 
 
 		 620 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  35.26 
 
 		 689 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  35.4 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  42.6 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  34.78 
 
 		 668 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  34.78 
 
 		 671 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  34.78 
 
 		 669 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  35.22 
 
 		 640 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  33.91 
 
 		 652 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  39.26 
 
 		 197 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  34.57 
 
 		 237 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  38.24 
 
 		 564 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  28.89 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  42.77 
 
 		 684 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  32.95 
 
 		 684 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  32.95 
 
 		 684 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  36.57 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  32.37 
 
 		 683 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  39.55 
 
 		 179 aa  92.4  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  28.8 
 
 		 234 aa  92.4  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  38.57 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  35.07 
 
 		 251 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  35.07 
 
 		 251 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  35.67 
 
 		 688 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  30.05 
 
 		 247 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  33.5 
 
 		 226 aa  89.4  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  32.32 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  36.36 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  32.76 
 
 		 656 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  30.9 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  37.8 
 
 		 641 aa  85.9  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  33.16 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  28.57 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.95 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  32.76 
 
 		 667 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  37.89 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  37.89 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  36.08 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  29.55 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  32.39 
 
 		 260 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  38.04 
 
 		 400 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  28.5 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.87 
 
 		 208 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2913  Endopeptidase Clp  31.11 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3465  hypothetical protein  35.51 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2151  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.48 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  29.51 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.33 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.78 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0750  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.88 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  30.67 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1088  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  30.15 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.850787  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1448  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.34 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1265  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.76 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0197  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.61 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389971  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1830  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.61 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  25.74 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08021  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.67 
 
 		 195 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1169  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.07 
 
 		 210 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1706  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  29.1 
 
 		 229 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08031  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.67 
 
 		 195 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2322  endopeptidase Clp  29.32 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0352296 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1554  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.67 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.242253  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.4 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1247  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.55 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.063421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1465  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  27.82 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.909373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2206  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.62 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28390  protease subunit of ATP-dependent protease  28.57 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>