More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0361 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 280 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 280 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  72.14 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  72.14 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  58.52 
 
 		 282 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  54.3 
 
 		 287 aa  289  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  51.24 
 
 		 280 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  51.42 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  49.62 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  53.11 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  49.24 
 
 		 284 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  49.65 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  48.94 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  45.55 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  42.37 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  42.37 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  46.5 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  41.24 
 
 		 651 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  41.24 
 
 		 651 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  42.2 
 
 		 1156 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  42.78 
 
 		 361 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  40.34 
 
 		 668 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  40.34 
 
 		 669 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  42.01 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  42.01 
 
 		 229 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  40.34 
 
 		 671 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  40.7 
 
 		 652 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  43.21 
 
 		 216 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  39.35 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  41.67 
 
 		 640 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  40.91 
 
 		 684 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  40.91 
 
 		 684 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  41.61 
 
 		 247 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  40.34 
 
 		 683 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  40 
 
 		 689 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  40.13 
 
 		 242 aa  122  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  35.71 
 
 		 620 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  41.18 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  39.77 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  33.48 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  39.08 
 
 		 674 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  39.61 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  41.98 
 
 		 688 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  41.03 
 
 		 656 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  36.42 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  42.25 
 
 		 179 aa  106  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  36.32 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  37.59 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  37.59 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  35.41 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  39.16 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  39.56 
 
 		 365 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  36.65 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  35.53 
 
 		 351 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  36.22 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  33.33 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  41.67 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  40.11 
 
 		 684 aa  99.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  36.54 
 
 		 243 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  35.75 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  36.56 
 
 		 381 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  38.22 
 
 		 667 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  33.74 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  33.82 
 
 		 564 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  35.26 
 
 		 229 aa  94  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  31.25 
 
 		 387 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  36.42 
 
 		 345 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  35.62 
 
 		 383 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  38.85 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  38.85 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  37.13 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  37.01 
 
 		 641 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  37.93 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  35.54 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  34.81 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2407  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.87 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3465  hypothetical protein  44.93 
 
 		 140 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.15 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2151  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.58 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.66 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  31.85 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1440  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.49 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.53484  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08021  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.83 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.58 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08441  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.4 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0799239  hitchhiker  0.00187741 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15461  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.83 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.614772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  29.71 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1059  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.49 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0750  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.83 
 
 		 195 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  28 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28390  protease subunit of ATP-dependent protease  27.97 
 
 		 197 aa  57  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10817 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08031  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.83 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819808  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0628  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.01 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0385  peptidase S14, ClpP  28.47 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.546462  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08421  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.22 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2913  Endopeptidase Clp  32 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.88 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  30.83 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2382  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  27.94 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.656103  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2030  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.94 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>