More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2473 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  100 
 
 		 227 aa  463  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  42.86 
 
 		 668 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  42.86 
 
 		 671 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  42.86 
 
 		 669 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  44.79 
 
 		 651 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  44.79 
 
 		 651 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  43.63 
 
 		 1156 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  44.09 
 
 		 640 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  39.9 
 
 		 689 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  42.08 
 
 		 652 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  42.11 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  38.3 
 
 		 684 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  38.3 
 
 		 683 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  38.3 
 
 		 684 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  38.02 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  36.76 
 
 		 257 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  36.76 
 
 		 257 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  41.21 
 
 		 564 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  36.98 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  47.68 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  37.67 
 
 		 656 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  42.6 
 
 		 287 aa  131  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  40.51 
 
 		 688 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  32.14 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  36.92 
 
 		 667 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  39.47 
 
 		 361 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  31.7 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  31.7 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  41.1 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  37.74 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  43.04 
 
 		 280 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  43.67 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  39.05 
 
 		 280 aa  121  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  41.03 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  41.18 
 
 		 280 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  41.18 
 
 		 280 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  37.29 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  40.54 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  40.54 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  34.36 
 
 		 674 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  35 
 
 		 620 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  36.7 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  39.38 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  36.17 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  33.33 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  37.11 
 
 		 351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  33.33 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  42.96 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  43.59 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  39.55 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  42.5 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  44.03 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  33.67 
 
 		 381 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  43.67 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  42.4 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  34.48 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  43.04 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  41.21 
 
 		 284 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  36.53 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  35.68 
 
 		 345 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  42.77 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  37.97 
 
 		 260 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  38.55 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  37.97 
 
 		 684 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  30.3 
 
 		 383 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  31.82 
 
 		 387 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  42.75 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  42.75 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  38.65 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  37.76 
 
 		 641 aa  88.6  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.94 
 
 		 196 aa  85.9  5e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  33.72 
 
 		 260 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  37.5 
 
 		 208 aa  85.1  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  32.09 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  35.29 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  34.01 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  37.98 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08441  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35.48 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0799239  hitchhiker  0.00187741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1247  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  38.24 
 
 		 196 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.063421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0917  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.55 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0776  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  35.86 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.76 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3324  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35.38 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.09384 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0389  peptidase S14, ClpP  35.61 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0601848  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  35.97 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2956  endopeptidase Clp  35.29 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152745  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2312  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  35.94 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3424  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  34.27 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.55 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1059  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.95 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2206  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.29 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09641  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.55 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.486621  normal  0.137034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  33.33 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1169  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.58 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.56 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1109  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.42074  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2009  Endopeptidase Clp  33.57 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0464642  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1088  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  36.5 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.850787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2030  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  34.09 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>