More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1629 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 242 aa  494  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  71.67 
 
 		 229 aa  340  9e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  71.67 
 
 		 229 aa  340  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  64.85 
 
 		 242 aa  315  5e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  66.38 
 
 		 226 aa  286  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  53.04 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  47.69 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  46.25 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  50.67 
 
 		 243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  44.44 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  40.22 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  40.54 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  35.41 
 
 		 280 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  35.41 
 
 		 280 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  40.68 
 
 		 282 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  40.54 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  39.64 
 
 		 280 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  39.57 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  42.05 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  41.96 
 
 		 620 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  39.01 
 
 		 668 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  39.01 
 
 		 671 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  39.01 
 
 		 669 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  43.06 
 
 		 640 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  41.83 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  39.55 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  36.26 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  37.2 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  37.2 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  40.24 
 
 		 1156 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  40.24 
 
 		 651 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  40.24 
 
 		 651 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  47.86 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  38.65 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  36.79 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  36.79 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  38.12 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  41.5 
 
 		 652 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  41.57 
 
 		 281 aa  108  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  33.94 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  30.88 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  39.57 
 
 		 365 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  33.49 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  33.49 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  38.04 
 
 		 351 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  42.86 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  37.21 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  35.29 
 
 		 688 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  39.88 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  31.16 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  40.31 
 
 		 689 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  39.29 
 
 		 279 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  41.73 
 
 		 197 aa  99  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  34.16 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  34.68 
 
 		 230 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  35.81 
 
 		 387 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  37.98 
 
 		 684 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  37.98 
 
 		 684 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  37.98 
 
 		 683 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  35.81 
 
 		 381 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  40 
 
 		 284 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  39.84 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  34.46 
 
 		 383 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  36.42 
 
 		 674 aa  89  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  39.06 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  39.06 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  36.36 
 
 		 641 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  34.51 
 
 		 564 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  39.13 
 
 		 684 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  35.92 
 
 		 179 aa  85.5  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  31.72 
 
 		 345 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.53 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  31.37 
 
 		 656 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  31.29 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  32.12 
 
 		 667 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  32.06 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.27 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.52 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.33 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11730  protease subunit of ATP-dependent protease  33.82 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533928  normal  0.37296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5374  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  31.82 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1180  hypothetical protein  32.33 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.222987 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  26.67 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0809  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.58 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0793  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.58 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2151  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.06 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  32.84 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0436  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.58 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  33.33 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  28.48 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3143  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.58 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  28.75 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2407  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.34 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428709  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0710  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.33 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5312  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.58 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3195  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.7 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000375799  hitchhiker  0.000337967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  37.21 
 
 		 400 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4829  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.58 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4844  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.58 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0232  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.58 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.798089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>