More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1484 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  100 
 
 		 223 aa  460  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  53.28 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  53.28 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  52.08 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  56.14 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  53.04 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  50.82 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  49.71 
 
 		 244 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  44.37 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  47.1 
 
 		 260 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  38.89 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  43.28 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  34.73 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  33.52 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  33.52 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  34.95 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  35.5 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  32.09 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  38.26 
 
 		 361 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  37.27 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  37.27 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  33.54 
 
 		 280 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  41.13 
 
 		 179 aa  101  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  41.41 
 
 		 1156 aa  101  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  40.31 
 
 		 684 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  42.06 
 
 		 651 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  40.31 
 
 		 683 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  40.31 
 
 		 684 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  42.06 
 
 		 651 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  31.87 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  37.06 
 
 		 237 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  39.68 
 
 		 652 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  31.22 
 
 		 280 aa  98.2  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  37.86 
 
 		 689 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  35.66 
 
 		 620 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  36.99 
 
 		 669 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  36.99 
 
 		 640 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  37.32 
 
 		 671 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  37.32 
 
 		 668 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  47.66 
 
 		 365 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  39.86 
 
 		 300 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  33.53 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  38.89 
 
 		 564 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  32.39 
 
 		 387 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  33.71 
 
 		 381 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  33.14 
 
 		 284 aa  89.4  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  32.61 
 
 		 284 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  30.27 
 
 		 251 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  31.25 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  29.84 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  33.33 
 
 		 688 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  29.84 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  36.81 
 
 		 281 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  35.15 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  37.64 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  37.64 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  37.33 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  32.74 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  32.33 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  33.92 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  31.93 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  33.33 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  30.95 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  31.55 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  30.19 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  35.67 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.54 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  29.3 
 
 		 351 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.01 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  28.4 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  29.81 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5374  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.83 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  31.41 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  32 
 
 		 656 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.71 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  32.33 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  32.82 
 
 		 641 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  33.59 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1978  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.09 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0100238 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  31.33 
 
 		 667 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  36.92 
 
 		 674 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  32.35 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  31.29 
 
 		 684 aa  72  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  31.16 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  30.17 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04370  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 2  32.43 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1294  Endopeptidase Clp  31.01 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1305  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.05 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.06 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.43 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2178  Endopeptidase Clp  26.29 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.661234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.65 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0787  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.47 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44382  predicted protein  33.59 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1260  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.77 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0553999  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0065  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.6 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  29.86 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0319  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.65 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1102  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.3 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0062  peptidase S14, ClpP  31.22 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>