More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3399 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  82.21 
 
 
203 aa  346  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  71.72 
 
 
213 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  67.01 
 
 
217 aa  275  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  72.57 
 
 
192 aa  274  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  66.85 
 
 
207 aa  268  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  70.11 
 
 
213 aa  267  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  68.51 
 
 
214 aa  267  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  62.81 
 
 
213 aa  264  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  62.24 
 
 
213 aa  262  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  70 
 
 
195 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  63.78 
 
 
225 aa  258  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  67.82 
 
 
213 aa  258  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  66.47 
 
 
238 aa  251  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  63.89 
 
 
236 aa  250  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.2 
 
 
240 aa  248  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  57.97 
 
 
213 aa  248  6e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  65.14 
 
 
221 aa  247  7e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  65.73 
 
 
200 aa  246  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  61.33 
 
 
208 aa  243  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  62.92 
 
 
213 aa  241  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  61.05 
 
 
205 aa  240  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  62.36 
 
 
206 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  59.44 
 
 
194 aa  239  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  60.99 
 
 
207 aa  237  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  55.05 
 
 
219 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  66.27 
 
 
211 aa  236  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  60.69 
 
 
194 aa  236  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  56.37 
 
 
204 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  62.01 
 
 
211 aa  235  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  64.5 
 
 
207 aa  234  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  63.69 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  63.91 
 
 
210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  63.69 
 
 
203 aa  232  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  62.13 
 
 
207 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.11 
 
 
194 aa  231  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  62.71 
 
 
205 aa  231  5e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  60.22 
 
 
197 aa  231  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.57 
 
 
218 aa  230  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  62.35 
 
 
214 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.59 
 
 
200 aa  228  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.57 
 
 
195 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.57 
 
 
195 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.57 
 
 
195 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  59.17 
 
 
211 aa  222  3e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  57.14 
 
 
197 aa  220  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  51.27 
 
 
203 aa  219  3e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  58.14 
 
 
205 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  63.43 
 
 
229 aa  214  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  56.8 
 
 
207 aa  214  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  58.24 
 
 
198 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.01 
 
 
212 aa  211  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0436  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.8 
 
 
194 aa  209  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0793  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.14 
 
 
195 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0809  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.14 
 
 
195 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1107  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.21 
 
 
206 aa  209  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.350822  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1432  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.74 
 
 
193 aa  208  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.53269  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0235  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.55 
 
 
203 aa  208  6e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0233  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.55 
 
 
203 aa  208  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.196502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  52.88 
 
 
205 aa  207  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3143  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.55 
 
 
196 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1088  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.51 
 
 
194 aa  206  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.850787  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40933  predicted protein  57.99 
 
 
188 aa  205  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  58.14 
 
 
202 aa  205  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0322  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.16 
 
 
201 aa  205  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.95 
 
 
200 aa  205  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2966  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.36 
 
 
196 aa  204  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000055055  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1702  endopeptidase Clp  53.59 
 
 
224 aa  204  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2562  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.36 
 
 
195 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2924  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.55 
 
 
229 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2740  endopeptidase Clp  53.22 
 
 
206 aa  203  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600762  decreased coverage  0.00246808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.55 
 
 
229 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1845  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  59.17 
 
 
198 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000342072  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.4 
 
 
222 aa  202  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0377  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.21 
 
 
193 aa  202  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2037  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  52.98 
 
 
228 aa  202  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1143  Endopeptidase Clp  56.55 
 
 
229 aa  202  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193015  normal  0.493164 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0489  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.76 
 
 
200 aa  201  8e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.148245  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1941  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.8 
 
 
225 aa  201  9e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.47 
 
 
199 aa  201  9e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151699  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2301  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.47 
 
 
199 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618373 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1512  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50 
 
 
200 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4574  Endopeptidase Clp  57.14 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0573  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.36 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0934  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.85 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.593149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1855  Endopeptidase Clp  53.53 
 
 
196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.726179  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1177  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.36 
 
 
200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0148  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  52.38 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0054433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1095  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.36 
 
 
207 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000583712  hitchhiker  0.00000378515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.95 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.629733  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1514  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.49 
 
 
203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0984  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.44 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1479  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.17 
 
 
198 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000813663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2693  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  52.84 
 
 
205 aa  199  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000240407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0818  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.03 
 
 
207 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5224  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.17 
 
 
217 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0528  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.17 
 
 
199 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00155065  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2234  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.78 
 
 
231 aa  199  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0943  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.88 
 
 
199 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6156  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.17 
 
 
217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>