More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4919 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  100 
 
 
236 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  76.32 
 
 
238 aa  309  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  75.66 
 
 
213 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  75.13 
 
 
213 aa  305  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  70.43 
 
 
192 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  63.13 
 
 
221 aa  278  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  65.31 
 
 
214 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  67.91 
 
 
213 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  70.33 
 
 
213 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  67.38 
 
 
213 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  72 
 
 
225 aa  271  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  64.4 
 
 
207 aa  268  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  64.97 
 
 
240 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  66.85 
 
 
217 aa  261  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  65.22 
 
 
195 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  65.08 
 
 
207 aa  258  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  63.73 
 
 
213 aa  257  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  63.1 
 
 
197 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  62.69 
 
 
206 aa  254  6e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  64.52 
 
 
194 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  69.89 
 
 
200 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  62.57 
 
 
213 aa  252  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  64.97 
 
 
194 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  61.22 
 
 
207 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  65.71 
 
 
207 aa  250  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  61.88 
 
 
211 aa  250  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  64.48 
 
 
203 aa  249  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  63.89 
 
 
210 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  65.71 
 
 
211 aa  248  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  62.9 
 
 
210 aa  248  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  65.71 
 
 
205 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  64.4 
 
 
197 aa  246  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  58.17 
 
 
214 aa  246  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  59.12 
 
 
208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  64.41 
 
 
218 aa  241  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  64.57 
 
 
200 aa  241  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  61.22 
 
 
195 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  61.22 
 
 
195 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  61.22 
 
 
195 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  63.84 
 
 
194 aa  241  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  59.38 
 
 
203 aa  239  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  63.01 
 
 
206 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  62.43 
 
 
205 aa  238  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  59.14 
 
 
219 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  62.57 
 
 
211 aa  236  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  68.07 
 
 
205 aa  234  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  58 
 
 
212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  59.24 
 
 
207 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  56.91 
 
 
203 aa  232  5e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1479  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  58.56 
 
 
198 aa  229  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000813663  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  64.41 
 
 
229 aa  229  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.54 
 
 
231 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.629733  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2966  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.25 
 
 
196 aa  224  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000055055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0322  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.65 
 
 
201 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3143  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.25 
 
 
196 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2693  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  58.72 
 
 
205 aa  223  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000240407  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2525  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.14 
 
 
244 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1230  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.07 
 
 
194 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000738057  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1177  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.14 
 
 
200 aa  221  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4364  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  58.66 
 
 
236 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.375461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  53.81 
 
 
205 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  54.92 
 
 
204 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  59.06 
 
 
198 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3694  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.98 
 
 
193 aa  218  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0547  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.8 
 
 
204 aa  218  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  57.8 
 
 
229 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2924  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  57.8 
 
 
229 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1915  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.4 
 
 
199 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180231  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0489  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.23 
 
 
200 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.148245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.23 
 
 
200 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2037  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  54.91 
 
 
228 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3604  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.49 
 
 
232 aa  216  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2562  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.73 
 
 
195 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0385  peptidase S14, ClpP  56.65 
 
 
225 aa  216  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.546462  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4985  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  59.54 
 
 
207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935151  normal  0.656558 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0389  peptidase S14, ClpP  55.49 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0601848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1928  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  57.8 
 
 
197 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000803868  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1107  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.14 
 
 
206 aa  216  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.350822  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0528  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.4 
 
 
199 aa  215  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00155065  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1734  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.49 
 
 
201 aa  215  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.132166  normal  0.350369 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0233  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.23 
 
 
203 aa  215  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.196502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0235  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.23 
 
 
203 aa  215  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1748  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.91 
 
 
219 aa  214  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.623801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5224  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.23 
 
 
217 aa  214  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.42 
 
 
202 aa  214  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0984  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.89 
 
 
202 aa  214  9e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18461  Clp protease proteolytic subunit  54.34 
 
 
214 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18651  Clp protease proteolytic subunit  54.34 
 
 
214 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1837  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.49 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1946  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.23 
 
 
217 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1841  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.23 
 
 
217 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714013  normal  0.0188426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1718  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  56 
 
 
209 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.866088  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1568  Endopeptidase Clp  53.01 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463332  normal  0.0340848 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3421  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  54.3 
 
 
204 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461069  normal  0.155928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0709  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  58.38 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6156  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.23 
 
 
217 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1647  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.4 
 
 
194 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1385  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.4 
 
 
194 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0104132  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1911  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.23 
 
 
217 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.467927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1923  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.23 
 
 
217 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>