More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4896 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  70.26 
 
 
240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  66.3 
 
 
194 aa  257  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  64.32 
 
 
217 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  66.48 
 
 
213 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  65.03 
 
 
213 aa  255  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  65.52 
 
 
225 aa  254  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  64.89 
 
 
213 aa  254  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  64.64 
 
 
194 aa  252  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  62.7 
 
 
214 aa  252  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  60.66 
 
 
211 aa  251  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  67.24 
 
 
200 aa  249  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  58.71 
 
 
213 aa  248  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  59.2 
 
 
213 aa  247  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  62.22 
 
 
195 aa  246  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  57.95 
 
 
207 aa  245  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  62.43 
 
 
221 aa  245  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  62.43 
 
 
192 aa  244  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  64.97 
 
 
238 aa  243  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  59.47 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  65 
 
 
211 aa  238  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  59.78 
 
 
205 aa  238  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  55.05 
 
 
210 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  62.84 
 
 
218 aa  237  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  59.14 
 
 
236 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  61.83 
 
 
195 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  61.05 
 
 
207 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  56.41 
 
 
213 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  61.83 
 
 
195 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  61.83 
 
 
195 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  60.44 
 
 
203 aa  235  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  62.64 
 
 
194 aa  234  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  61.11 
 
 
197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  58.06 
 
 
203 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  55.5 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  55.05 
 
 
207 aa  232  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  60 
 
 
197 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  58.38 
 
 
212 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  58.76 
 
 
206 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  56.84 
 
 
204 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  59.44 
 
 
205 aa  228  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  55.94 
 
 
205 aa  228  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  56.32 
 
 
207 aa  228  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  55.08 
 
 
214 aa  227  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  59.44 
 
 
200 aa  226  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  58.92 
 
 
211 aa  225  4e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.14 
 
 
208 aa  223  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  56.35 
 
 
203 aa  222  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  56.08 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  53.72 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  60.45 
 
 
229 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  58.72 
 
 
205 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44382  predicted protein  56.07 
 
 
260 aa  201  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329065  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2740  endopeptidase Clp  51.14 
 
 
206 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600762  decreased coverage  0.00246808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0934  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  51.63 
 
 
209 aa  197  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.593149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0322  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  50.8 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2120  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.04 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.11 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2924  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.11 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2693  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  46.73 
 
 
205 aa  194  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000240407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3348  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.49 
 
 
217 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0216407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2365  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.49 
 
 
217 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2323  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.49 
 
 
217 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0415791  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1465  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.49 
 
 
207 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0878215  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2481  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.49 
 
 
207 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1232  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.49 
 
 
217 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2966  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  46.67 
 
 
196 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000055055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.09 
 
 
200 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0908  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  50 
 
 
209 aa  193  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1957  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.49 
 
 
217 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0389  peptidase S14, ClpP  51.91 
 
 
225 aa  193  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0601848  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2030  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  51.91 
 
 
227 aa  192  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1230  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  46.7 
 
 
194 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000738057  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0377  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  47.83 
 
 
193 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348831  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5224  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50 
 
 
217 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.55 
 
 
231 aa  192  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.629733  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1568  Endopeptidase Clp  50.54 
 
 
195 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463332  normal  0.0340848 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0405  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  52.46 
 
 
225 aa  191  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1845  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  51.1 
 
 
198 aa  191  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000342072  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1946  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50 
 
 
217 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1841  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50 
 
 
217 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714013  normal  0.0188426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6156  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50 
 
 
217 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1911  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50 
 
 
217 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.467927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1923  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50 
 
 
217 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1349  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50 
 
 
217 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131844  normal  0.0275798 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1479  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.9 
 
 
198 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000813663  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0385  peptidase S14, ClpP  50.54 
 
 
225 aa  189  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.546462  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3535  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  52.72 
 
 
201 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2037  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  48.92 
 
 
228 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1855  Endopeptidase Clp  49.74 
 
 
196 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.726179  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1734  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  49.17 
 
 
201 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.132166  normal  0.350369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2957  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  51.16 
 
 
216 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2579  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  52.72 
 
 
201 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0824369  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2511  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50.87 
 
 
202 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004044  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.13 
 
 
208 aa  188  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000645167  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0100  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  50 
 
 
202 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862905 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0062  peptidase S14, ClpP  55.06 
 
 
207 aa  188  5e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0065  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.01 
 
 
224 aa  188  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0511  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  48.91 
 
 
197 aa  188  5e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.1021  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1209  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50.87 
 
 
202 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>