More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3699 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  100 
 
 
205 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  70 
 
 
200 aa  266  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1649  Endopeptidase Clp  63.24 
 
 
231 aa  258  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.203339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  61.61 
 
 
211 aa  257  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  62.93 
 
 
240 aa  254  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  65.96 
 
 
212 aa  248  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8639  Endopeptidase Clp  62.44 
 
 
208 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2178  Endopeptidase Clp  64.32 
 
 
208 aa  239  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.661234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2039  Endopeptidase Clp  65.05 
 
 
201 aa  237  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  0.0203848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  62.11 
 
 
204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1478  Endopeptidase Clp  62.63 
 
 
206 aa  231  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.515266  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  55.94 
 
 
219 aa  228  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  61.36 
 
 
211 aa  224  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  59.43 
 
 
214 aa  221  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  53.81 
 
 
236 aa  221  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  58.7 
 
 
213 aa  221  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  58.15 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  60.34 
 
 
225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  54.4 
 
 
203 aa  216  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  56.04 
 
 
213 aa  217  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  54.84 
 
 
192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  56.28 
 
 
217 aa  214  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  56 
 
 
213 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  55.49 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  57.39 
 
 
195 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  52.6 
 
 
207 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.32 
 
 
197 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.73 
 
 
195 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  56.57 
 
 
205 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  55.43 
 
 
213 aa  209  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.73 
 
 
195 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.73 
 
 
195 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.35 
 
 
200 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.82 
 
 
208 aa  208  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  53.09 
 
 
206 aa  208  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  55.87 
 
 
194 aa  208  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.3 
 
 
218 aa  207  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  57.39 
 
 
207 aa  207  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.9 
 
 
238 aa  207  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  52.88 
 
 
210 aa  207  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.95 
 
 
194 aa  206  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  55.75 
 
 
221 aa  205  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  55.25 
 
 
207 aa  204  9e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  51.85 
 
 
214 aa  202  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  56 
 
 
207 aa  203  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  53.55 
 
 
203 aa  202  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.19 
 
 
205 aa  201  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  52.46 
 
 
194 aa  201  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  55.49 
 
 
206 aa  201  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  53.8 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  50 
 
 
203 aa  200  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  52.6 
 
 
213 aa  199  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  56.55 
 
 
211 aa  197  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  52.15 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  48.47 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0065  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.07 
 
 
224 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0062  peptidase S14, ClpP  53.49 
 
 
207 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  58.06 
 
 
229 aa  191  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4985  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  52.75 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935151  normal  0.656558 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00691  Clp protease proteolytic subunit  52.57 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176795 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17821  Clp protease proteolytic subunit  50.87 
 
 
200 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18461  Clp protease proteolytic subunit  50 
 
 
214 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18651  Clp protease proteolytic subunit  50 
 
 
214 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  53.8 
 
 
205 aa  184  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1254  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  48.88 
 
 
194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  50.29 
 
 
229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2924  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  50.29 
 
 
229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1748  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  49.42 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.623801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.39 
 
 
200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21251  Clp protease proteolytic subunit  48.88 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44382  predicted protein  51.11 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5374  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  52.02 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2966  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  49.73 
 
 
196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000055055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2030  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  50.29 
 
 
218 aa  180  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203097  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0322  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  48.9 
 
 
201 aa  179  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3143  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  49.18 
 
 
196 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18461  Clp protease proteolytic subunit  48.28 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  50 
 
 
202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0505091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1230  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  47.54 
 
 
194 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000738057  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2525  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  49.71 
 
 
244 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3694  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  47.28 
 
 
193 aa  177  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  50.82 
 
 
200 aa  177  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40933  predicted protein  50 
 
 
188 aa  177  9e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247184  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1798  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  50 
 
 
201 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2579  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  50.29 
 
 
201 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0824369  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3132  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  50.58 
 
 
229 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3535  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  50.29 
 
 
201 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1554  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  48.3 
 
 
209 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1734  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  47.98 
 
 
201 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.132166  normal  0.350369 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0984  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  45.41 
 
 
202 aa  176  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0762  Endopeptidase Clp  52.6 
 
 
204 aa  176  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0888582  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0389  peptidase S14, ClpP  49.42 
 
 
225 aa  176  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0601848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1459  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.55 
 
 
202 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0547  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  50.58 
 
 
204 aa  175  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2923  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  49.71 
 
 
232 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.125386  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1479  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  46.99 
 
 
198 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000813663  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2957  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  49.13 
 
 
216 aa  175  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  46.7 
 
 
231 aa  175  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.629733  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  47.64 
 
 
199 aa  174  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1272  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.09 
 
 
199 aa  174  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>