More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1649 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1649  Endopeptidase Clp  100 
 
 
231 aa  470  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.203339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  63.24 
 
 
205 aa  258  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2178  Endopeptidase Clp  62.56 
 
 
208 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.661234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8639  Endopeptidase Clp  56.65 
 
 
208 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2039  Endopeptidase Clp  54.69 
 
 
201 aa  221  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  0.0203848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  57.75 
 
 
200 aa  218  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1478  Endopeptidase Clp  56.5 
 
 
206 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.515266  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.19 
 
 
212 aa  205  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.31 
 
 
240 aa  204  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  53.3 
 
 
204 aa  203  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  54.6 
 
 
211 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  47.62 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  50.28 
 
 
213 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  50.57 
 
 
205 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  51.15 
 
 
225 aa  185  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  49.16 
 
 
213 aa  185  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  51.7 
 
 
211 aa  184  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  49.72 
 
 
213 aa  184  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.23 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  48.5 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  46.84 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  48.13 
 
 
203 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  51.15 
 
 
195 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  49.44 
 
 
205 aa  180  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  49.73 
 
 
210 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  45.31 
 
 
197 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  48.47 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  46.81 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.09 
 
 
200 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  46.46 
 
 
218 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  50 
 
 
207 aa  179  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  45.88 
 
 
214 aa  178  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  46.6 
 
 
194 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50.57 
 
 
195 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50.57 
 
 
195 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50.57 
 
 
195 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  50 
 
 
197 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  47.22 
 
 
221 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50.29 
 
 
194 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  46.96 
 
 
206 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  50 
 
 
203 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  50 
 
 
206 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  47.78 
 
 
207 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  45.86 
 
 
213 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  45.86 
 
 
213 aa  175  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.88 
 
 
208 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  48.63 
 
 
207 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  46.67 
 
 
213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  44.27 
 
 
203 aa  171  6.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  45.65 
 
 
207 aa  171  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  46.33 
 
 
210 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  46.24 
 
 
192 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  44.51 
 
 
213 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  46.75 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00691  Clp protease proteolytic subunit  45.61 
 
 
224 aa  161  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  45.24 
 
 
202 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0505091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  42.05 
 
 
207 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0065  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  45.18 
 
 
224 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0062  peptidase S14, ClpP  44.58 
 
 
207 aa  154  8e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2511  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  45.83 
 
 
202 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4985  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  46.39 
 
 
207 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935151  normal  0.656558 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44382  predicted protein  45.81 
 
 
260 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329065  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1254  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  41.62 
 
 
194 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21251  Clp protease proteolytic subunit  41.62 
 
 
218 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17821  Clp protease proteolytic subunit  43.98 
 
 
200 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.93 
 
 
198 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1459  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  46.39 
 
 
202 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.83 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0306  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  44 
 
 
240 aa  152  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844592  normal  0.63492 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2518  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit  43.5 
 
 
193 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0042866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2593  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  42.94 
 
 
193 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000952131  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2037  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  44.58 
 
 
228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2798  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.5 
 
 
193 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0490951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2840  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.5 
 
 
193 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0219476  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2957  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  45.78 
 
 
216 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18461  Clp protease proteolytic subunit  42.17 
 
 
214 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18651  Clp protease proteolytic subunit  42.17 
 
 
214 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  47.49 
 
 
229 aa  151  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40933  predicted protein  44.57 
 
 
188 aa  151  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2599  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  43.5 
 
 
193 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.686807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2551  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit  43.5 
 
 
193 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0150155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2795  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.5 
 
 
193 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000720553 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2788  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  43.5 
 
 
193 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.774499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0528  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  45.18 
 
 
199 aa  151  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00155065  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2693  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.75 
 
 
205 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000240407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2966  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  44.44 
 
 
196 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000055055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1845  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  42.08 
 
 
198 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000342072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1910  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  42.37 
 
 
194 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3694  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.83 
 
 
193 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  47.27 
 
 
200 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2740  endopeptidase Clp  41.8 
 
 
206 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600762  decreased coverage  0.00246808 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0762  Endopeptidase Clp  46.99 
 
 
204 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0888582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3143  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.37 
 
 
196 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1748  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  41.57 
 
 
219 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.623801  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30030  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  39.42 
 
 
251 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160952  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1128  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  44.64 
 
 
202 aa  149  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.332941  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  47.77 
 
 
205 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.61 
 
 
217 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.692844  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1906  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.61 
 
 
217 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4371  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.37 
 
 
202 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307002  normal  0.681724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>