More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1370 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  100 
 
 
207 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  79.7 
 
 
213 aa  329  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  79.19 
 
 
213 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  72.28 
 
 
213 aa  294  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  69.12 
 
 
213 aa  290  9e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  69.43 
 
 
217 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  70.97 
 
 
214 aa  284  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  70.21 
 
 
238 aa  281  6.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  67.38 
 
 
213 aa  278  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  66.16 
 
 
221 aa  274  6e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  65.78 
 
 
194 aa  269  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  66.67 
 
 
194 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  64.4 
 
 
236 aa  268  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  65.78 
 
 
192 aa  268  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  66.85 
 
 
210 aa  268  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  64.74 
 
 
203 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  64.02 
 
 
240 aa  261  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  66.67 
 
 
195 aa  260  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  63.87 
 
 
213 aa  260  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  59.41 
 
 
206 aa  259  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  68.42 
 
 
211 aa  258  3e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  66.48 
 
 
225 aa  258  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  59.8 
 
 
213 aa  257  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  63.83 
 
 
207 aa  256  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.07 
 
 
208 aa  254  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  68.39 
 
 
207 aa  252  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  58.76 
 
 
207 aa  251  7e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  63.16 
 
 
211 aa  249  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  60.82 
 
 
203 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  61.58 
 
 
214 aa  248  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  65 
 
 
197 aa  248  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  64.74 
 
 
205 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  57.95 
 
 
219 aa  245  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  59.07 
 
 
197 aa  242  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  62.57 
 
 
195 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  62.57 
 
 
195 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  62.57 
 
 
195 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  60.62 
 
 
207 aa  238  5e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  62.01 
 
 
206 aa  238  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.42 
 
 
218 aa  236  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  63.64 
 
 
200 aa  236  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  64.37 
 
 
194 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  58.51 
 
 
203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  58.12 
 
 
211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  61.14 
 
 
200 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.22 
 
 
210 aa  234  9e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  56.48 
 
 
205 aa  228  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  63.91 
 
 
205 aa  225  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  56.54 
 
 
204 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  61.17 
 
 
229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  58.19 
 
 
229 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2924  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  58.19 
 
 
229 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  59.88 
 
 
200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1479  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.98 
 
 
198 aa  214  8e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000813663  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1845  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  60.82 
 
 
198 aa  213  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000342072  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.84 
 
 
212 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1230  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.98 
 
 
194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000738057  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1568  Endopeptidase Clp  54.91 
 
 
195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463332  normal  0.0340848 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0544  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  54.7 
 
 
217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1855  Endopeptidase Clp  55.17 
 
 
196 aa  211  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.726179  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1294  Endopeptidase Clp  58.72 
 
 
234 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1536  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.89 
 
 
215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.203633  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1869  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.89 
 
 
215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0480172  normal  0.0203228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5224  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.73 
 
 
217 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0233  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.4 
 
 
203 aa  211  7e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.196502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0235  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.4 
 
 
203 aa  211  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04370  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit 2  57.31 
 
 
224 aa  211  7.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0934  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.14 
 
 
209 aa  210  9e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.593149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2120  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.56 
 
 
207 aa  210  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1432  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.56 
 
 
193 aa  211  9e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.53269  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2009  Endopeptidase Clp  57.31 
 
 
219 aa  210  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0464642  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1349  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.73 
 
 
217 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131844  normal  0.0275798 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0405  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.88 
 
 
225 aa  210  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1946  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.73 
 
 
217 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6156  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.73 
 
 
217 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1841  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.73 
 
 
217 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714013  normal  0.0188426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1911  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.73 
 
 
217 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.467927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1923  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.73 
 
 
217 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  52.6 
 
 
205 aa  210  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1232  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.98 
 
 
217 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1465  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.98 
 
 
207 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0878215  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2323  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.98 
 
 
217 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0415791  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2481  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.98 
 
 
207 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2037  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  52.33 
 
 
228 aa  209  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2365  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.98 
 
 
217 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3348  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.98 
 
 
217 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1957  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.98 
 
 
217 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2030  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  52.94 
 
 
227 aa  208  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162468  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.97 
 
 
222 aa  208  4e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2562  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.56 
 
 
195 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1107  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.56 
 
 
206 aa  208  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.350822  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1711  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.43 
 
 
217 aa  208  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0549127  normal  0.0370612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.56 
 
 
219 aa  208  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  0.818355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3604  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.56 
 
 
232 aa  208  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1143  Endopeptidase Clp  53.07 
 
 
229 aa  208  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193015  normal  0.493164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.93 
 
 
231 aa  208  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.629733  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1440  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.14 
 
 
218 aa  207  7e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.53484  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2740  endopeptidase Clp  53.22 
 
 
206 aa  207  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600762  decreased coverage  0.00246808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3143  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.98 
 
 
196 aa  207  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1702  endopeptidase Clp  54.97 
 
 
224 aa  207  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>