More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3583 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  100 
 
 
195 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  100 
 
 
195 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  100 
 
 
195 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  95.26 
 
 
218 aa  374  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  94.74 
 
 
194 aa  374  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  87.89 
 
 
200 aa  350  8e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  79.46 
 
 
207 aa  309  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  76.6 
 
 
197 aa  302  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  71.28 
 
 
211 aa  293  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  66.49 
 
 
197 aa  266  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  68.54 
 
 
205 aa  265  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  65.78 
 
 
206 aa  259  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  67.04 
 
 
225 aa  257  6e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  68.09 
 
 
213 aa  256  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  63.4 
 
 
207 aa  255  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  67.55 
 
 
213 aa  255  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  65.19 
 
 
221 aa  255  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  65.75 
 
 
213 aa  254  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  65.76 
 
 
213 aa  254  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  68.36 
 
 
240 aa  254  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  66.29 
 
 
217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  63.35 
 
 
213 aa  252  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  66.85 
 
 
214 aa  252  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  66.12 
 
 
207 aa  251  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  67.6 
 
 
195 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  66.3 
 
 
213 aa  250  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  61.78 
 
 
214 aa  247  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  65.14 
 
 
210 aa  246  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  65.22 
 
 
213 aa  244  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  66.29 
 
 
206 aa  242  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  64.64 
 
 
208 aa  242  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  61.83 
 
 
194 aa  241  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  63.98 
 
 
211 aa  242  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  61.22 
 
 
236 aa  241  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  65.91 
 
 
238 aa  241  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  67.61 
 
 
200 aa  241  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  66.29 
 
 
203 aa  240  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  62.57 
 
 
207 aa  238  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  64.04 
 
 
205 aa  238  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  61.96 
 
 
211 aa  238  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  67.03 
 
 
229 aa  237  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  61.83 
 
 
219 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  62.71 
 
 
194 aa  234  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  59.36 
 
 
203 aa  234  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  62.86 
 
 
207 aa  234  6e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  60.33 
 
 
192 aa  230  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  61.8 
 
 
203 aa  229  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  60.57 
 
 
210 aa  228  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  59.78 
 
 
212 aa  225  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  60.8 
 
 
204 aa  221  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  61.8 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0528  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  58.96 
 
 
199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00155065  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3143  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.47 
 
 
196 aa  214  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  59.88 
 
 
200 aa  214  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1095  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  59.3 
 
 
207 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000583712  hitchhiker  0.00000378515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2740  endopeptidase Clp  56.07 
 
 
206 aa  211  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600762  decreased coverage  0.00246808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  56.82 
 
 
231 aa  211  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.629733  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0984  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.31 
 
 
202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1107  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.89 
 
 
206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.350822  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1177  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.98 
 
 
200 aa  211  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0904  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.56 
 
 
207 aa  211  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000979846  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3694  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
193 aa  210  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0551  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.56 
 
 
207 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0035525  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0490  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  57.56 
 
 
243 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00691281  normal  0.831328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3068  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.98 
 
 
207 aa  210  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.201714  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0488  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  57.56 
 
 
243 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000119673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0507  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.56 
 
 
207 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0766472  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2966  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.56 
 
 
196 aa  209  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000055055  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0497  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.56 
 
 
207 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00957782  hitchhiker  0.000182361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  55.73 
 
 
205 aa  209  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40933  predicted protein  57.71 
 
 
188 aa  210  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247184  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.17 
 
 
222 aa  209  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.56 
 
 
207 aa  208  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.153991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  57.56 
 
 
207 aa  208  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.64318e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0360  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.56 
 
 
207 aa  208  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.93543e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3195  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.56 
 
 
207 aa  208  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000375799  hitchhiker  0.000337967 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0235  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
203 aa  208  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0473  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.56 
 
 
207 aa  208  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00392  hypothetical protein  57.56 
 
 
207 aa  208  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.12461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0480  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.56 
 
 
207 aa  208  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0233  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
203 aa  208  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.196502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0514  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.56 
 
 
207 aa  208  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.86752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2693  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.43 
 
 
205 aa  208  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000240407  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1254  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.49 
 
 
194 aa  208  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2120  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
207 aa  208  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3604  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.39 
 
 
232 aa  207  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21251  Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
218 aa  207  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1718  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.81 
 
 
209 aa  207  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.866088  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2495  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.86 
 
 
203 aa  207  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198217  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17821  Clp protease proteolytic subunit  56 
 
 
200 aa  207  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2323  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
217 aa  207  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0415791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2365  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
217 aa  207  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3264  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.65 
 
 
207 aa  207  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.30385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3348  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
217 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0216407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1232  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
217 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  61.88 
 
 
205 aa  207  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2876  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.4 
 
 
207 aa  207  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0812738  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1957  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
217 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2481  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
207 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1928  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.81 
 
 
197 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000803868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>