More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3401 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  100 
 
 
192 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  75 
 
 
214 aa  309  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  77.35 
 
 
213 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  75.14 
 
 
213 aa  299  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  74.32 
 
 
217 aa  296  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  74.59 
 
 
213 aa  296  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  73.08 
 
 
238 aa  281  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  70.43 
 
 
236 aa  279  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  72.83 
 
 
203 aa  277  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  70.88 
 
 
213 aa  274  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  72.38 
 
 
195 aa  274  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  72.57 
 
 
210 aa  274  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  70.33 
 
 
213 aa  272  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  69.61 
 
 
225 aa  270  8.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  65.78 
 
 
207 aa  268  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  66.48 
 
 
221 aa  263  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  66.49 
 
 
240 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  65.57 
 
 
211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  62.84 
 
 
194 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  61.41 
 
 
194 aa  251  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  64.52 
 
 
213 aa  252  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  67.21 
 
 
197 aa  250  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  63.13 
 
 
213 aa  247  9e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  58.7 
 
 
208 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  62.98 
 
 
197 aa  245  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  62.43 
 
 
219 aa  244  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  65.14 
 
 
207 aa  244  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  60.75 
 
 
206 aa  243  9e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  63.44 
 
 
211 aa  243  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  64.97 
 
 
200 aa  242  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  64.04 
 
 
205 aa  242  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  60.66 
 
 
214 aa  241  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  64 
 
 
200 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  61.71 
 
 
211 aa  238  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  61.38 
 
 
203 aa  237  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  62.09 
 
 
206 aa  237  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  63.33 
 
 
205 aa  237  9e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  61.71 
 
 
207 aa  235  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  62.29 
 
 
210 aa  235  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  59.12 
 
 
207 aa  234  6e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  58.38 
 
 
204 aa  231  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.33 
 
 
195 aa  230  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.33 
 
 
195 aa  230  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.33 
 
 
195 aa  230  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  62.15 
 
 
194 aa  230  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  63.01 
 
 
218 aa  228  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  64.07 
 
 
205 aa  228  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  59.54 
 
 
207 aa  224  6e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  57.63 
 
 
203 aa  224  7e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  60.34 
 
 
212 aa  222  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  62.15 
 
 
229 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  54.84 
 
 
205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.23 
 
 
198 aa  214  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2924  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  59.54 
 
 
229 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44382  predicted protein  59.66 
 
 
260 aa  213  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329065  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  59.54 
 
 
229 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1432  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  58.96 
 
 
193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.53269  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2579  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.91 
 
 
201 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0824369  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3535  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.91 
 
 
201 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0322  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.68 
 
 
201 aa  211  7e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.65 
 
 
219 aa  210  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  0.818355 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2693  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.5 
 
 
205 aa  210  9e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000240407  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1088  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.68 
 
 
194 aa  210  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.850787  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3604  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.22 
 
 
232 aa  209  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.54 
 
 
231 aa  209  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.629733  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2562  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.31 
 
 
195 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.42 
 
 
200 aa  208  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2525  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  58.86 
 
 
244 aa  207  8e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.65 
 
 
217 aa  207  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.692844  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1906  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.65 
 
 
217 aa  207  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1748  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.49 
 
 
219 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.623801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1845  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  59.3 
 
 
198 aa  206  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000342072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0489  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.56 
 
 
200 aa  206  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.148245  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1479  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.73 
 
 
198 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000813663  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18461  Clp protease proteolytic subunit  54.91 
 
 
214 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3424  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.25 
 
 
203 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18651  Clp protease proteolytic subunit  54.91 
 
 
214 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0436  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.39 
 
 
194 aa  205  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0547  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.49 
 
 
204 aa  205  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5224  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
217 aa  205  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2120  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.65 
 
 
207 aa  205  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.87 
 
 
202 aa  204  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0793  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.39 
 
 
195 aa  204  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0809  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.39 
 
 
195 aa  204  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2036  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.98 
 
 
196 aa  204  6e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6156  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
217 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1911  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
217 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.467927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1923  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
217 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1841  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
217 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714013  normal  0.0188426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1946  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
217 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2365  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
217 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2323  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
217 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0415791  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3348  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
217 aa  204  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1957  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
217 aa  204  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1232  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
217 aa  204  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1349  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
217 aa  204  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131844  normal  0.0275798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1514  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.6 
 
 
203 aa  204  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1465  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
207 aa  204  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0878215  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2481  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
207 aa  204  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1465  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  54.97 
 
 
207 aa  204  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.909373  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>