More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0642 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  100 
 
 
194 aa  401  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  90.62 
 
 
194 aa  368  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  65.28 
 
 
213 aa  270  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  66.67 
 
 
207 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  65.43 
 
 
213 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  65.62 
 
 
217 aa  268  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  69.06 
 
 
238 aa  266  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  65.03 
 
 
213 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  68.16 
 
 
213 aa  265  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  67.6 
 
 
213 aa  263  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  65.75 
 
 
221 aa  261  4.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  66.3 
 
 
214 aa  261  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  64.84 
 
 
213 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  64.61 
 
 
195 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  64.77 
 
 
225 aa  256  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  60.96 
 
 
213 aa  255  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  64.52 
 
 
236 aa  253  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  64.64 
 
 
219 aa  252  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  62.84 
 
 
192 aa  252  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  62.16 
 
 
214 aa  251  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  60.44 
 
 
207 aa  250  7e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  62.7 
 
 
240 aa  250  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  66.86 
 
 
207 aa  249  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  61.45 
 
 
206 aa  248  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  61.93 
 
 
207 aa  245  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  65.38 
 
 
211 aa  244  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  60.99 
 
 
197 aa  243  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  60 
 
 
210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  59.44 
 
 
210 aa  239  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.81 
 
 
208 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  63.07 
 
 
200 aa  240  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  58.7 
 
 
203 aa  238  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  61.2 
 
 
211 aa  238  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  63.07 
 
 
200 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  60 
 
 
203 aa  236  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  64.37 
 
 
211 aa  235  4e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  58.12 
 
 
205 aa  234  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  62.71 
 
 
195 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  62.71 
 
 
195 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  62.71 
 
 
195 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  63.58 
 
 
218 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  63.58 
 
 
194 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  59.78 
 
 
203 aa  234  6e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  58.01 
 
 
206 aa  234  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  58.79 
 
 
207 aa  231  5e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  61.14 
 
 
197 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.22 
 
 
205 aa  228  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  59.54 
 
 
204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  64.38 
 
 
205 aa  217  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1946  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.14 
 
 
217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  61.11 
 
 
229 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1841  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.14 
 
 
217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714013  normal  0.0188426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6156  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.14 
 
 
217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1911  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.14 
 
 
217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.467927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1923  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.14 
 
 
217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0934  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.49 
 
 
209 aa  214  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.593149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3697  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
211 aa  215  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0377  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  52.13 
 
 
193 aa  215  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2120  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.65 
 
 
207 aa  215  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5224  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.14 
 
 
217 aa  214  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2323  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.62 
 
 
217 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0415791  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1232  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.62 
 
 
217 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2365  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.62 
 
 
217 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3348  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.62 
 
 
217 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0216407  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1349  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.14 
 
 
217 aa  214  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131844  normal  0.0275798 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1957  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.62 
 
 
217 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1465  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.06 
 
 
207 aa  214  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0878215  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2481  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.06 
 
 
207 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0100  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.93 
 
 
202 aa  213  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1711  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0549127  normal  0.0370612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1869  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.59 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0480172  normal  0.0203228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2693  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  51.89 
 
 
205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000240407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1536  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.59 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.203633  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.75 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3143  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  49.74 
 
 
196 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.7 
 
 
216 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415428  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2525  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.54 
 
 
244 aa  209  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18461  Clp protease proteolytic subunit  52.49 
 
 
214 aa  209  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0908  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.18 
 
 
209 aa  209  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.39 
 
 
219 aa  209  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  0.818355 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18651  Clp protease proteolytic subunit  52.49 
 
 
214 aa  209  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1906  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.88 
 
 
217 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.88 
 
 
217 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.692844  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18461  Clp protease proteolytic subunit  52.51 
 
 
204 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1254  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  52.22 
 
 
194 aa  208  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1677  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  53.41 
 
 
212 aa  208  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.209719  normal  0.102806 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1748  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  51.93 
 
 
219 aa  208  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.623801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  51.83 
 
 
202 aa  207  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17821  Clp protease proteolytic subunit  53.07 
 
 
200 aa  207  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00691  Clp protease proteolytic subunit  54.19 
 
 
224 aa  207  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176795 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3234  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.76 
 
 
207 aa  207  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0374566  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3092  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.76 
 
 
207 aa  207  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3054  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.76 
 
 
207 aa  207  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311725  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21251  Clp protease proteolytic subunit  51.93 
 
 
218 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.59 
 
 
229 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0528  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  51.93 
 
 
199 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00155065  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  52.57 
 
 
202 aa  206  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0505091 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1885  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.49 
 
 
216 aa  206  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  46.91 
 
 
200 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2924  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.59 
 
 
229 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>