More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12486 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  100 
 
 
200 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  88.14 
 
 
218 aa  357  5e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  89.53 
 
 
194 aa  357  7e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  87.89 
 
 
195 aa  350  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  87.89 
 
 
195 aa  350  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  87.89 
 
 
195 aa  350  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  77.42 
 
 
207 aa  310  9e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  75.94 
 
 
197 aa  303  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  70.05 
 
 
211 aa  280  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  70.27 
 
 
197 aa  277  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  66.85 
 
 
205 aa  269  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  65.24 
 
 
206 aa  259  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  63.3 
 
 
214 aa  254  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  66.67 
 
 
213 aa  254  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  63.24 
 
 
213 aa  254  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  65.17 
 
 
221 aa  254  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  66.14 
 
 
213 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  62.11 
 
 
214 aa  251  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  64.25 
 
 
217 aa  250  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  64.84 
 
 
207 aa  250  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  66.67 
 
 
240 aa  250  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  63.49 
 
 
213 aa  250  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  65.71 
 
 
225 aa  249  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  64.48 
 
 
207 aa  249  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  64.02 
 
 
213 aa  248  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  64.97 
 
 
210 aa  247  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  66.29 
 
 
195 aa  247  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  62.64 
 
 
211 aa  244  6e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  61.33 
 
 
213 aa  243  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  62.3 
 
 
213 aa  243  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  63.64 
 
 
194 aa  242  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  64.57 
 
 
236 aa  241  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  63.54 
 
 
208 aa  241  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  67.2 
 
 
229 aa  240  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  64.25 
 
 
238 aa  239  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  64 
 
 
192 aa  238  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  64.94 
 
 
203 aa  238  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  64.37 
 
 
206 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  63.64 
 
 
207 aa  236  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  63.07 
 
 
194 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  64.74 
 
 
200 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  57.3 
 
 
203 aa  235  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  60.66 
 
 
211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  61.93 
 
 
205 aa  232  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  61.71 
 
 
204 aa  231  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  61.75 
 
 
203 aa  229  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  59.02 
 
 
207 aa  230  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  56.59 
 
 
210 aa  228  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  59.44 
 
 
219 aa  226  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  58.1 
 
 
212 aa  225  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3143  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.47 
 
 
196 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2966  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.23 
 
 
196 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000055055  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44382  predicted protein  59.06 
 
 
260 aa  215  4e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3604  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.39 
 
 
232 aa  214  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40933  predicted protein  59.06 
 
 
188 aa  213  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  58.72 
 
 
200 aa  213  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1718  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  56.65 
 
 
209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.866088  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2120  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.65 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1885  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.91 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1711  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.91 
 
 
217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0549127  normal  0.0370612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  58.99 
 
 
202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  63.12 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
219 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  0.818355 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1465  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0878215  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2481  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3348  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0216407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2365  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1748  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.49 
 
 
219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.623801  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2323  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0415791  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1232  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.49 
 
 
231 aa  211  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.629733  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1957  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0528  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.65 
 
 
199 aa  211  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00155065  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0984  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.14 
 
 
202 aa  211  7e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18651  Clp protease proteolytic subunit  54.91 
 
 
214 aa  211  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18461  Clp protease proteolytic subunit  54.91 
 
 
214 aa  211  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.76 
 
 
222 aa  210  9e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1928  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  54.75 
 
 
197 aa  210  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000803868  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17821  Clp protease proteolytic subunit  54.86 
 
 
200 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3068  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.4 
 
 
207 aa  210  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.201714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1906  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.06 
 
 
217 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.06 
 
 
217 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.692844  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2693  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.4 
 
 
205 aa  209  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000240407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1845  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.18 
 
 
198 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000342072  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1869  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.76 
 
 
215 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0480172  normal  0.0203228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  54.35 
 
 
205 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1536  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.76 
 
 
215 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.203633  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1177  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.49 
 
 
200 aa  209  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2923  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.68 
 
 
232 aa  209  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.125386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1459  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.07 
 
 
202 aa  208  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0062  peptidase S14, ClpP  56.14 
 
 
207 aa  208  5e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0377  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  57.31 
 
 
193 aa  208  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348831  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0065  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  56.73 
 
 
224 aa  207  6e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1209  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.65 
 
 
202 aa  207  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21251  Clp protease proteolytic subunit  54.34 
 
 
218 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1254  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.34 
 
 
194 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5224  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.76 
 
 
217 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1128  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.65 
 
 
202 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.332941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  56.82 
 
 
200 aa  206  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>