More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1098 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  100 
 
 
205 aa  423  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  77.17 
 
 
197 aa  304  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  67.37 
 
 
211 aa  281  7.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  64.95 
 
 
207 aa  277  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  66.67 
 
 
197 aa  271  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  66.85 
 
 
200 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  66.85 
 
 
194 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  66.85 
 
 
218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  68.54 
 
 
195 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  68.54 
 
 
195 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  68.54 
 
 
195 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  66.84 
 
 
225 aa  262  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  64.48 
 
 
206 aa  261  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  64.29 
 
 
210 aa  260  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  65.73 
 
 
207 aa  258  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  63.64 
 
 
213 aa  258  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  64.61 
 
 
207 aa  254  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  66.1 
 
 
213 aa  254  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  63.49 
 
 
213 aa  252  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  64.86 
 
 
203 aa  252  2.0000000000000002e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  63.98 
 
 
213 aa  251  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  66.47 
 
 
207 aa  250  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  65.91 
 
 
213 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  62.64 
 
 
214 aa  250  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  60.1 
 
 
213 aa  250  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  65.34 
 
 
213 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  61.66 
 
 
238 aa  248  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  65.71 
 
 
236 aa  246  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  64.74 
 
 
207 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  63.1 
 
 
205 aa  244  9e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  66.32 
 
 
229 aa  244  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  64.77 
 
 
217 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  61.24 
 
 
221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  64.04 
 
 
192 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  62.71 
 
 
195 aa  242  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  65.32 
 
 
240 aa  241  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  60.56 
 
 
214 aa  240  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  63.74 
 
 
206 aa  239  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  61.05 
 
 
210 aa  240  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  58.33 
 
 
194 aa  240  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  61.02 
 
 
208 aa  239  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  67.06 
 
 
203 aa  239  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  58.25 
 
 
211 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  65.12 
 
 
200 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  58.12 
 
 
194 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  64.5 
 
 
203 aa  234  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  61.27 
 
 
211 aa  229  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  59.44 
 
 
219 aa  228  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  60.11 
 
 
204 aa  223  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.63 
 
 
212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  60 
 
 
205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2924  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.59 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.59 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  53.98 
 
 
231 aa  210  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.629733  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  56.57 
 
 
205 aa  209  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1514  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  51.65 
 
 
203 aa  208  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3604  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.55 
 
 
232 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5224  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.39 
 
 
217 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2120  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.71 
 
 
207 aa  206  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1349  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.39 
 
 
217 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131844  normal  0.0275798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1946  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.39 
 
 
217 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1841  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.39 
 
 
217 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714013  normal  0.0188426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6156  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.39 
 
 
217 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  54.07 
 
 
200 aa  206  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1911  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.39 
 
 
217 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.467927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1923  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.39 
 
 
217 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2030  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  53.18 
 
 
227 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162468  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2957  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.49 
 
 
216 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3348  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.12 
 
 
217 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0216407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1465  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.12 
 
 
207 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0878215  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2481  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.12 
 
 
207 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2365  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.12 
 
 
217 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2036  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.39 
 
 
196 aa  205  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2323  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.12 
 
 
217 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0415791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2030  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.49 
 
 
218 aa  205  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203097  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1232  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.12 
 
 
217 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.11 
 
 
200 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1957  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.12 
 
 
217 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1798  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.17 
 
 
201 aa  204  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.18 
 
 
219 aa  204  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  0.818355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2579  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  54.91 
 
 
201 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0824369  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0934  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.18 
 
 
209 aa  204  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.593149  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3535  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  54.91 
 
 
201 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1837  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.76 
 
 
226 aa  204  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  54.55 
 
 
202 aa  204  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1254  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  51.74 
 
 
194 aa  204  8e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0766  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.98 
 
 
192 aa  204  8e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1459  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.91 
 
 
202 aa  204  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3143  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  51.43 
 
 
196 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1906  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.18 
 
 
217 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0547  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  53.45 
 
 
204 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0389  peptidase S14, ClpP  52.02 
 
 
225 aa  203  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0601848  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1748  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  52.6 
 
 
219 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.623801  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.18 
 
 
217 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.692844  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0405  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  49.22 
 
 
225 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1209  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.76 
 
 
202 aa  203  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18461  Clp protease proteolytic subunit  52.02 
 
 
214 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2525  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.49 
 
 
244 aa  202  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1095  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  54.39 
 
 
207 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000583712  hitchhiker  0.00000378515 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18651  Clp protease proteolytic subunit  52.02 
 
 
214 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>