More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2039 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2039  Endopeptidase Clp  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  0.0203848 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2178  Endopeptidase Clp  70.26 
 
 
208 aa  288  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.661234  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1478  Endopeptidase Clp  69.39 
 
 
206 aa  288  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.515266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8639  Endopeptidase Clp  68 
 
 
208 aa  287  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  65.05 
 
 
205 aa  237  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1649  Endopeptidase Clp  54.69 
 
 
231 aa  221  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.203339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  56.98 
 
 
200 aa  214  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.07 
 
 
212 aa  209  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  52.76 
 
 
211 aa  188  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  50.27 
 
 
214 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  51.79 
 
 
225 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  51.12 
 
 
221 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  50.89 
 
 
211 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  50.56 
 
 
213 aa  181  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  49.71 
 
 
205 aa  180  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  47.62 
 
 
213 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  48.28 
 
 
197 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  47.4 
 
 
213 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  47.83 
 
 
236 aa  177  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.62 
 
 
240 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  49.73 
 
 
217 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  49.7 
 
 
197 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  44.5 
 
 
219 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  50.57 
 
 
204 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  49.71 
 
 
195 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  49.11 
 
 
207 aa  175  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.54 
 
 
218 aa  174  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.52 
 
 
200 aa  174  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  49.12 
 
 
194 aa  174  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.54 
 
 
195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.54 
 
 
195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.54 
 
 
195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  49.14 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  47.06 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  49.72 
 
 
238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  45.09 
 
 
214 aa  171  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  48.86 
 
 
194 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  45.88 
 
 
205 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  46.29 
 
 
213 aa  170  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  46.75 
 
 
207 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  45.36 
 
 
206 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  45.71 
 
 
206 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  41.18 
 
 
210 aa  168  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  45.6 
 
 
203 aa  167  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  44.81 
 
 
192 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  44.81 
 
 
203 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  41.49 
 
 
203 aa  165  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  47.34 
 
 
211 aa  164  5e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  46.07 
 
 
213 aa  164  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  52.07 
 
 
229 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  46.15 
 
 
210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  45.51 
 
 
213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  46.45 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  44.57 
 
 
213 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  42.78 
 
 
207 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  44.44 
 
 
207 aa  158  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  41.95 
 
 
202 aa  158  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0505091 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1869  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.5 
 
 
215 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0480172  normal  0.0203228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1536  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.5 
 
 
215 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.203633  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1711  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  44.07 
 
 
217 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0549127  normal  0.0370612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2030  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  41.38 
 
 
218 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203097  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1459  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.53 
 
 
202 aa  154  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1841  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.53 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714013  normal  0.0188426 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2323  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.35 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0415791  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1465  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.35 
 
 
207 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0878215  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1946  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.53 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2481  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.35 
 
 
207 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2120  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.35 
 
 
207 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2365  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.35 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6156  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.53 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1911  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.53 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.467927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1923  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.53 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1232  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.35 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3348  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.35 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1957  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.35 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5224  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.53 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2511  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  40.8 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40933  predicted protein  45.66 
 
 
188 aa  152  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247184  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30030  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  43.79 
 
 
251 aa  152  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1230  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.68 
 
 
194 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000738057  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1349  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.53 
 
 
217 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131844  normal  0.0275798 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0065  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  45.29 
 
 
224 aa  151  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  40.8 
 
 
200 aa  151  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0489  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.53 
 
 
200 aa  151  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.148245  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1128  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  40.8 
 
 
202 aa  151  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.332941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1209  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  40.8 
 
 
202 aa  151  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2037  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.11 
 
 
228 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0062  peptidase S14, ClpP  43.18 
 
 
207 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2966  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  40.8 
 
 
196 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000055055  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3132  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  44.05 
 
 
229 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1906  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  41.62 
 
 
217 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  41.38 
 
 
216 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415428  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0377  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  38.64 
 
 
193 aa  149  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  41.62 
 
 
217 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.692844  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0934  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  40.34 
 
 
209 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.593149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1885  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  40.8 
 
 
216 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4985  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  42.77 
 
 
207 aa  149  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935151  normal  0.656558 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2740  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  39.43 
 
 
194 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360863  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0908  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  39.2 
 
 
209 aa  148  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2645  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  38.64 
 
 
202 aa  148  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309785  normal  0.0470319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>