More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1478 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1478  Endopeptidase Clp  100 
 
 
206 aa  414  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.515266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8639  Endopeptidase Clp  79 
 
 
208 aa  319  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2178  Endopeptidase Clp  74.26 
 
 
208 aa  299  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.661234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2039  Endopeptidase Clp  69.39 
 
 
201 aa  288  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  0.0203848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  62.63 
 
 
205 aa  231  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1649  Endopeptidase Clp  56.5 
 
 
231 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.203339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  56.19 
 
 
200 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.1 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.72 
 
 
240 aa  185  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  49.21 
 
 
204 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  48.94 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  50.52 
 
 
211 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  48.7 
 
 
203 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  47.28 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  48.4 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  50.57 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  51.72 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  49.17 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  49.72 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  46.89 
 
 
214 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  48.57 
 
 
207 aa  170  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  47.28 
 
 
207 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  45.26 
 
 
197 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  46.63 
 
 
210 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  49.72 
 
 
205 aa  168  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  47.09 
 
 
195 aa  168  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  46.2 
 
 
200 aa  168  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  48.09 
 
 
192 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  47.85 
 
 
213 aa  167  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  50 
 
 
197 aa  167  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  49.44 
 
 
213 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  49.44 
 
 
213 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  48.04 
 
 
213 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  48.82 
 
 
206 aa  165  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  49.71 
 
 
221 aa  165  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  47.49 
 
 
213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  47.34 
 
 
236 aa  164  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  48 
 
 
194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  46.11 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  47.22 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  49.71 
 
 
210 aa  162  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  47.75 
 
 
194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  45.05 
 
 
213 aa  161  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  44.02 
 
 
203 aa  161  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.57 
 
 
195 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.57 
 
 
195 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.57 
 
 
195 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  46.86 
 
 
194 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  47.49 
 
 
238 aa  157  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  48.5 
 
 
202 aa  158  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0505091 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44382  predicted protein  46.37 
 
 
260 aa  156  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329065  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  46.33 
 
 
207 aa  156  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  47.73 
 
 
205 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  45.65 
 
 
208 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30030  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  43.32 
 
 
251 aa  154  8e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  43.39 
 
 
207 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2645  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  45.83 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309785  normal  0.0470319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2030  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  44.44 
 
 
218 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203097  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40933  predicted protein  45.09 
 
 
188 aa  151  7e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2234  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  47.62 
 
 
231 aa  150  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3190  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.93 
 
 
215 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0240901  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  43.96 
 
 
213 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  48.57 
 
 
229 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  46.24 
 
 
211 aa  149  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1941  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  47.62 
 
 
225 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0776  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  44.38 
 
 
215 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108868  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2957  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  44.44 
 
 
216 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0306  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  45.83 
 
 
240 aa  147  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844592  normal  0.63492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2966  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.05 
 
 
196 aa  147  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000055055  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2511  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.51 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1554  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.71 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  42.19 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1128  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.71 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.332941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4371  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.11 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307002  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  48.5 
 
 
205 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0065  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  44.32 
 
 
224 aa  146  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4985  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  42.63 
 
 
207 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935151  normal  0.656558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0528  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.78 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00155065  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1459  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.11 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1209  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.11 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0972  endopeptidase Clp  41.97 
 
 
193 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000265141  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0062  peptidase S14, ClpP  43.75 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5374  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  41.27 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  41.18 
 
 
200 aa  144  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0377  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  40.1 
 
 
193 aa  144  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348831  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0389  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  41.04 
 
 
197 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.71 
 
 
216 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415428  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0810  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  40 
 
 
194 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.883413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2648  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  40.53 
 
 
194 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2544  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  41.92 
 
 
202 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00389922 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1608  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  41.67 
 
 
212 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191797  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1885  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.11 
 
 
216 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3143  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  41.88 
 
 
196 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1748  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  42.44 
 
 
219 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.623801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2740  endopeptidase Clp  41.62 
 
 
206 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600762  decreased coverage  0.00246808 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0908  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  44.38 
 
 
209 aa  142  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17821  Clp protease proteolytic subunit  41.62 
 
 
200 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00691  Clp protease proteolytic subunit  43.1 
 
 
224 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3604  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  42.69 
 
 
232 aa  142  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1260  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.16 
 
 
192 aa  142  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0553999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>