More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2178 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2178  Endopeptidase Clp  100 
 
 
208 aa  413  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.661234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8639  Endopeptidase Clp  75.25 
 
 
208 aa  305  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1478  Endopeptidase Clp  74.26 
 
 
206 aa  299  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.515266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2039  Endopeptidase Clp  70.26 
 
 
201 aa  288  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  0.0203848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1649  Endopeptidase Clp  62.56 
 
 
231 aa  251  7e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.203339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3699  Endopeptidase Clp  64.32 
 
 
205 aa  239  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  55.45 
 
 
200 aa  215  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  58.86 
 
 
212 aa  200  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  51.46 
 
 
211 aa  188  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  50 
 
 
225 aa  186  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.41 
 
 
240 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  50.52 
 
 
204 aa  184  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  48.68 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  48.44 
 
 
205 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  47.87 
 
 
214 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  51.45 
 
 
206 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  50.28 
 
 
195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  49.17 
 
 
217 aa  177  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  49.17 
 
 
203 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  54.97 
 
 
211 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  50.9 
 
 
207 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  50.28 
 
 
213 aa  175  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  48.63 
 
 
236 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  46.84 
 
 
203 aa  175  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  51.61 
 
 
238 aa  175  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  49.72 
 
 
213 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  52.63 
 
 
221 aa  175  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  49.43 
 
 
206 aa  174  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  51.5 
 
 
197 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  50.88 
 
 
213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  47.98 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  48.85 
 
 
213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  46.52 
 
 
203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  49.44 
 
 
207 aa  171  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  51.5 
 
 
197 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  50.29 
 
 
207 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  51.45 
 
 
218 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  50.29 
 
 
200 aa  168  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  48.85 
 
 
194 aa  168  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  51.45 
 
 
194 aa  167  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  47.43 
 
 
210 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  51.45 
 
 
195 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  51.45 
 
 
195 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  51.45 
 
 
195 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  44.04 
 
 
210 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  48.57 
 
 
208 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  45.36 
 
 
192 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  46.15 
 
 
213 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  44.79 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  45.6 
 
 
213 aa  164  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  45.3 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  48.52 
 
 
205 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  45.3 
 
 
213 aa  161  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  53.57 
 
 
229 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0065  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  46.11 
 
 
224 aa  158  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0062  peptidase S14, ClpP  45.56 
 
 
207 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  44.13 
 
 
202 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0505091 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00691  Clp protease proteolytic subunit  45.51 
 
 
224 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  44.38 
 
 
207 aa  154  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30030  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  41.71 
 
 
251 aa  155  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160952  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1798  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  45.14 
 
 
201 aa  154  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17821  Clp protease proteolytic subunit  43.5 
 
 
200 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.43 
 
 
200 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1459  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  44.57 
 
 
202 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2030  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  44 
 
 
218 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203097  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  46.15 
 
 
211 aa  153  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1128  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  43.5 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.332941  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1748  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  43.43 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.623801  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18461  Clp protease proteolytic subunit  43.43 
 
 
214 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2511  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.86 
 
 
202 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18651  Clp protease proteolytic subunit  43.43 
 
 
214 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40933  predicted protein  44.97 
 
 
188 aa  152  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1209  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.94 
 
 
202 aa  151  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2966  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  41.58 
 
 
196 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000055055  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1254  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  41.99 
 
 
194 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1514  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  41.62 
 
 
203 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  51.61 
 
 
205 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2957  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.43 
 
 
216 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21251  Clp protease proteolytic subunit  41.99 
 
 
218 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2579  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.18 
 
 
201 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0824369  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3535  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.18 
 
 
201 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1536  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  40.11 
 
 
215 aa  148  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.203633  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1869  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  40.11 
 
 
215 aa  148  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0480172  normal  0.0203228 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44382  predicted protein  43.75 
 
 
260 aa  147  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329065  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3190  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  40.82 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0240901  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_002620  TC0079  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  45.61 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  41.71 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415428  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2645  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  41.81 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309785  normal  0.0470319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1711  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  40.57 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0549127  normal  0.0370612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3132  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  42.05 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0547  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  43.02 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0389  peptidase S14, ClpP  43.68 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0601848  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.86 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  0.818355 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2036  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  39.47 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0528  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.29 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00155065  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0377  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  38.02 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1885  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  41.14 
 
 
216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2037  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  43.1 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0306  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  42.86 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844592  normal  0.63492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2693  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  39.78 
 
 
205 aa  145  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000240407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>