More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1086 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  64.17 
 
 		 229 aa  305  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  64.17 
 
 		 229 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  64.85 
 
 		 242 aa  292  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  60.83 
 
 		 226 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  52.08 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  49.3 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  45.87 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  49.37 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  40.61 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  42.31 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  45.1 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  40.85 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  40.85 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  40.13 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  40.13 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  47.69 
 
 		 668 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  47.69 
 
 		 671 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  47.69 
 
 		 640 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  44.52 
 
 		 669 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  41.18 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  37.43 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  43.06 
 
 		 361 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  43.59 
 
 		 1156 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  43.59 
 
 		 651 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  43.59 
 
 		 651 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  41.78 
 
 		 620 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  39.63 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  39.31 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  38.73 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  38.73 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  40 
 
 		 652 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  36.5 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  35.57 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  36.17 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  37.23 
 
 		 284 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  37.64 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  36.57 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  40.94 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  47.75 
 
 		 300 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  42.64 
 
 		 689 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  51.56 
 
 		 365 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  39.46 
 
 		 683 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  39.46 
 
 		 684 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  39.46 
 
 		 684 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  37.02 
 
 		 381 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  44.35 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  40.3 
 
 		 688 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  36.22 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  38.26 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  36.59 
 
 		 387 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  40.94 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  40.94 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  39.44 
 
 		 179 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  30.46 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  39.77 
 
 		 564 aa  98.6  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  35.98 
 
 		 383 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  41.41 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  34.04 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  34.94 
 
 		 351 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  35.15 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  33.71 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  38.85 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  40.62 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  38.71 
 
 		 284 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  38.22 
 
 		 279 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  38.93 
 
 		 656 aa  92.8  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  38.01 
 
 		 684 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  38.28 
 
 		 667 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  35.8 
 
 		 674 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  34.36 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  34.27 
 
 		 345 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  36.94 
 
 		 282 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  32.24 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  35.22 
 
 		 641 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  30.3 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  27.75 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  27.75 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.95 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  28.42 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1180  hypothetical protein  29.76 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.222987 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0570  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.29 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198349  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  28.31 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2009  Endopeptidase Clp  32.54 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0464642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  27.17 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11730  protease subunit of ATP-dependent protease  31.21 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533928  normal  0.37296 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0436  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.72 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1294  Endopeptidase Clp  28.18 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  26.32 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3081  Endopeptidase Clp  29.52 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  26.44 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1841  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.17 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714013  normal  0.0188426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1946  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.17 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6156  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.17 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1911  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.17 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.467927  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.82 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1923  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.17 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0017  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.75 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0809  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.12 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0793  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.12 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>