112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1205 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 300 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  59.68 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  55.83 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  34.18 
 
 		 365 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  44.35 
 
 		 226 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  47.75 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  46.96 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  44.44 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  43.59 
 
 		 229 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  38.97 
 
 		 223 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  35.29 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  41.12 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  38.46 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  38.46 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  42.17 
 
 		 651 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  42.17 
 
 		 1156 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  42.17 
 
 		 651 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  37.89 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  38.32 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  37.93 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  37.93 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  39.24 
 
 		 668 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  40 
 
 		 688 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  39.24 
 
 		 671 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  39.24 
 
 		 640 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  33.64 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  39.24 
 
 		 669 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  43.04 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  39.76 
 
 		 179 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  38.1 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  27.07 
 
 		 689 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  38.55 
 
 		 652 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  30.77 
 
 		 683 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  30.77 
 
 		 684 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  30.77 
 
 		 684 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  37 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  37.04 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  37.65 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  38.27 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  28.76 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  34.48 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  39.24 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  30.22 
 
 		 620 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  36.47 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  31.36 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  34.88 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  34.88 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  34.21 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  32.91 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  34.88 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  36.9 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  34.62 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  38.16 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  35 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  34.12 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  34.12 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  38.1 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  32.53 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  39.76 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  27.74 
 
 		 656 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  29.01 
 
 		 667 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  33.33 
 
 		 564 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  32.67 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  32.14 
 
 		 674 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  31.68 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  33.77 
 
 		 684 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  35.53 
 
 		 230 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  34.29 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1672  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.05 
 
 		 197 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.122412  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0628  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.39 
 
 		 194 aa  49.3  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  32.05 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  29.41 
 
 		 641 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  25.88 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1978  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.99 
 
 		 197 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0100238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  33.33 
 
 		 210 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1005  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  34.18 
 
 		 205 aa  46.6  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3591  endopeptidase Clp  34.72 
 
 		 211 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2407  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  34.67 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428709  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3785  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  34.18 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0806419  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0752  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  34.72 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.49 
 
 		 211 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  30.39 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  27.59 
 
 		 400 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  30.12 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  25.81 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2790  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.99 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1247  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.71 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  30.12 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.71 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.39 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0603  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.91 
 
 		 210 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  26.67 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  44.3  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.222987 
 
 
-
 
NC_004310  BR1109  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.38 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.42074  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1059  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.99 
 
 		 197 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2288  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.65 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139562  normal  0.536957 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.86 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2206  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.38 
 
 		 230 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2052  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.58 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.913784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2848  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35.21 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0259579 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>