More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5772 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  100 
 
 		 400 aa  795    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  45.42 
 
 		 351 aa  204  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  45.02 
 
 		 684 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3862  hypothetical protein  51.52 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  37.98 
 
 		 564 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  35.11 
 
 		 247 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  40.37 
 
 		 282 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  36.36 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  48.06 
 
 		 280 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  36.97 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  29.4 
 
 		 688 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  38.69 
 
 		 689 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  43.7 
 
 		 280 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  36.42 
 
 		 652 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  42.19 
 
 		 620 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  36.42 
 
 		 1156 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  36.36 
 
 		 683 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  36.42 
 
 		 651 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  36.36 
 
 		 684 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  36.36 
 
 		 684 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  36.42 
 
 		 651 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  33.95 
 
 		 216 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  36.7 
 
 		 280 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0283  hypothetical protein  46.46 
 
 		 194 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  38.89 
 
 		 287 aa  96.3  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  31.71 
 
 		 237 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  36.17 
 
 		 242 aa  93.2  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  36.92 
 
 		 244 aa  92.8  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  34.34 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  39.55 
 
 		 179 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  35.38 
 
 		 247 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  32.71 
 
 		 640 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  32.71 
 
 		 671 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  36.23 
 
 		 669 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  34.76 
 
 		 674 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  40.74 
 
 		 284 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  32.24 
 
 		 668 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  34.59 
 
 		 227 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  35.71 
 
 		 280 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  35.71 
 
 		 280 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  36.3 
 
 		 197 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  34.78 
 
 		 260 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  35.92 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  34.88 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  34.88 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  34.62 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  41.18 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  30.41 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  33.33 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  32.26 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  32.74 
 
 		 656 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  35.67 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  31.1 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  31.1 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  30.37 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  33.54 
 
 		 667 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  34.5 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  34.15 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  28.83 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  33.83 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  38.04 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  40.26 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  40.62 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  40.62 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  33.33 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  38.89 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  40.26 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  23.22 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.94 
 
 		 198 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  37.21 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  25.15 
 
 		 251 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  25.15 
 
 		 251 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.66 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1305  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.03 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0389  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.12 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.07 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  31.71 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4545  endopeptidase Clp  28.74 
 
 		 216 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843015  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.94 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11730  protease subunit of ATP-dependent protease  29.24 
 
 		 206 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533928  normal  0.37296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  29.8 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.37 
 
 		 235 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5374  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  30.71 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1265  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.34 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  28.67 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.74 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  32.17 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.34 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21030  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  29.66 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  30.23 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2742  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2009  Endopeptidase Clp  30.61 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0464642  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  26.38 
 
 		 207 aa  59.7  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0233  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.39 
 
 		 203 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.196502  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18461  Clp protease proteolytic subunit  29.2 
 
 		 204 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1702  endopeptidase Clp  29.93 
 
 		 224 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0235  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.39 
 
 		 203 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1928  Endopeptidase Clp  28.86 
 
 		 207 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000142088  normal  0.0321887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  25.62 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>