More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4252 on replicon NC_014149
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  44.68 
 
 		 361 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  38.89 
 
 		 244 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  40 
 
 		 689 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  41.83 
 
 		 243 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  41.43 
 
 		 684 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  41.43 
 
 		 683 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  41.43 
 
 		 684 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  42.14 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  37.58 
 
 		 620 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  40.71 
 
 		 651 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  40.71 
 
 		 651 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  40.71 
 
 		 1156 aa  111  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  39.29 
 
 		 652 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  38.32 
 
 		 282 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  44.19 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  43.59 
 
 		 227 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  38.96 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  39.86 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  42.25 
 
 		 280 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  42.25 
 
 		 280 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  40.74 
 
 		 674 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  38.41 
 
 		 257 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  38.41 
 
 		 257 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  41.96 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  36.52 
 
 		 251 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  36.52 
 
 		 251 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  39.29 
 
 		 669 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  39.29 
 
 		 640 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  39.29 
 
 		 671 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  34.27 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  39.44 
 
 		 242 aa  101  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  42.34 
 
 		 258 aa  101  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  40.31 
 
 		 280 aa  101  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  37.41 
 
 		 229 aa  101  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  40.8 
 
 		 351 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  38.57 
 
 		 668 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  43.41 
 
 		 365 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  41.13 
 
 		 237 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  45.31 
 
 		 247 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  45.31 
 
 		 248 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  45.04 
 
 		 279 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  45.04 
 
 		 279 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  46.15 
 
 		 684 aa  95.5  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  44.27 
 
 		 247 aa  95.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  37.01 
 
 		 229 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  37.01 
 
 		 229 aa  94.4  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  37.41 
 
 		 197 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  35.92 
 
 		 383 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  39.55 
 
 		 280 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  38.06 
 
 		 280 aa  92  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  36.43 
 
 		 216 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  36.6 
 
 		 234 aa  91.7  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  39.68 
 
 		 688 aa  90.9  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  36.64 
 
 		 230 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  35.29 
 
 		 281 aa  88.6  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  34.97 
 
 		 381 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  41.13 
 
 		 223 aa  87.4  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  39.53 
 
 		 226 aa  84.3  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  40.29 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  40.29 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  31.97 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  34.69 
 
 		 564 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  29.29 
 
 		 387 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  39.85 
 
 		 641 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  36.23 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  32.05 
 
 		 656 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  39.55 
 
 		 282 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  39.55 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  29.87 
 
 		 667 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  31.13 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  32.58 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  39.76 
 
 		 300 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  35.92 
 
 		 242 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  33.1 
 
 		 213 aa  70.9  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  32.35 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  32.81 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  28.89 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  29.85 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.3 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  31.03 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  31.34 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1527  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.43 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.73019  normal  0.314697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  31.34 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  32.35 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.15 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  32.06 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6060  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.2 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  30.15 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  31.43 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  30.34 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  28.66 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1830  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.58 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0197  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.58 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389971  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  33.33 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1696  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.28 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02985  Protease subunit of ATP-dependent Clp protease  29.79 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000129088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  32.06 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2790  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.01 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  34.35 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>