More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4920 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  100 
 
 		 365 aa  747    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  40.87 
 
 		 361 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  37.04 
 
 		 671 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  37.04 
 
 		 668 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  44.86 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  39.69 
 
 		 669 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  38.53 
 
 		 640 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  43.68 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  46.11 
 
 		 248 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  46.11 
 
 		 247 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  41.71 
 
 		 216 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  40.57 
 
 		 652 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  41.52 
 
 		 651 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  40.11 
 
 		 1156 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  41.52 
 
 		 651 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  32.67 
 
 		 689 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  43.17 
 
 		 683 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  43.17 
 
 		 684 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  43.17 
 
 		 684 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  47.27 
 
 		 247 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  45.21 
 
 		 244 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  39.15 
 
 		 247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  34.25 
 
 		 387 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  38.46 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.36 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  38.84 
 
 		 656 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  42.77 
 
 		 688 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  34.52 
 
 		 300 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  46.39 
 
 		 229 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  46.39 
 
 		 229 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  51.56 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  40.24 
 
 		 237 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  47.47 
 
 		 197 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  40.32 
 
 		 667 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  35.51 
 
 		 230 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  37.63 
 
 		 251 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  37.63 
 
 		 251 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  37.63 
 
 		 251 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  43.62 
 
 		 620 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  37.33 
 
 		 243 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  37.44 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  37.44 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  39.16 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  42.77 
 
 		 227 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  41.67 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  41.67 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  33.86 
 
 		 564 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  37.42 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  43.41 
 
 		 179 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  35.47 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  33.05 
 
 		 674 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  37.58 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  49.61 
 
 		 226 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  40.45 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  38.22 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  34.12 
 
 		 280 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  36.93 
 
 		 243 aa  99.8  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  36.77 
 
 		 280 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  32.33 
 
 		 260 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  47.66 
 
 		 223 aa  97.1  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  38.51 
 
 		 641 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  30.94 
 
 		 284 aa  93.6  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  34.81 
 
 		 351 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  32.63 
 
 		 284 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  40.31 
 
 		 229 aa  92  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  28.94 
 
 		 345 aa  89.7  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  36.87 
 
 		 284 aa  89.4  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  38.06 
 
 		 260 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  35.56 
 
 		 214 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  37.3 
 
 		 684 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2151  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.09 
 
 		 200 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  36.05 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  36.05 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3642  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  34.81 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.349726  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  35.63 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  35.63 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  36.08 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1978  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.12 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0100238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2052  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.21 
 
 		 201 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.913784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  34.15 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1647  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.12 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1385  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.12 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0104132  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2790  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.85 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  32.84 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  31.25 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0908  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.91 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2565  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.28 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1845  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.47 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000342072  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.85 
 
 		 222 aa  68.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0511  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.7 
 
 		 197 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.1021  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3785  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  31.02 
 
 		 220 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0806419  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15461  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.83 
 
 		 197 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.614772 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0065  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  32.89 
 
 		 224 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.89 
 
 		 198 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1177  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.28 
 
 		 200 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1531  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  31.21 
 
 		 208 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0954  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  33.12 
 
 		 199 aa  68.9  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.02611  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.91 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415428  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02985  Protease subunit of ATP-dependent Clp protease  33.83 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000129088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2740  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.05 
 
 		 194 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0360863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>