More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3437 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  100 
 
 		 345 aa  698    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  38.43 
 
 		 671 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  38.92 
 
 		 669 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  37.96 
 
 		 668 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  39.41 
 
 		 640 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  37.27 
 
 		 651 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  37.27 
 
 		 651 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  37.27 
 
 		 1156 aa  126  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  38.95 
 
 		 652 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  31.34 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  32.42 
 
 		 689 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  31.84 
 
 		 683 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  31.16 
 
 		 684 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  31.16 
 
 		 684 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  30.84 
 
 		 688 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  41.29 
 
 		 282 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  36.65 
 
 		 564 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  33.01 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  35.95 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  33.01 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  39.63 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  35.68 
 
 		 227 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  39.02 
 
 		 280 aa  99.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  36.84 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  30.65 
 
 		 387 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.45 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  32.94 
 
 		 287 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  37.95 
 
 		 237 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  31.69 
 
 		 251 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  35.98 
 
 		 280 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  33.99 
 
 		 229 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  29.06 
 
 		 251 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  33.99 
 
 		 229 aa  90.1  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  29.06 
 
 		 251 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  36.42 
 
 		 280 aa  90.1  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  36.42 
 
 		 280 aa  90.1  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  34.08 
 
 		 247 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  37.04 
 
 		 218 aa  87.8  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  36.03 
 
 		 284 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  31.98 
 
 		 656 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  36.49 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  34.27 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  34.08 
 
 		 248 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  30.73 
 
 		 230 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  31.76 
 
 		 234 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  35.54 
 
 		 247 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0197  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  38.13 
 
 		 210 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389971  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1830  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  38.13 
 
 		 210 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  25.73 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  34.13 
 
 		 667 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1448  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  38.13 
 
 		 210 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1169  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.17 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  41.09 
 
 		 674 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  33.11 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  35.16 
 
 		 620 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  31.97 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  35.25 
 
 		 211 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  33.81 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  29.66 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  30.04 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2913  Endopeptidase Clp  34.75 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2206  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.57 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  30.38 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1527  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.29 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.73019  normal  0.314697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2371  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.69 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1109  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.36 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.42074  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0418  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.09 
 
 		 222 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.169971 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.57 
 
 		 228 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2184  endopeptidase Clp  35.25 
 
 		 217 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.604475  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2416  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35.97 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2679  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35.97 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  31.09 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0546  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.81 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02153  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  37.42 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  37.42 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1265  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.57 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5134  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35.25 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  35.77 
 
 		 211 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2848  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35.82 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0259579 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0901  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  36.43 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7405  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  35.25 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  32.37 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.78 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.53 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  31.41 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.84 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0202  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.82 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.211478  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0872  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.33 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.323505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  34.84 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  34.84 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  34.04 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1706  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  31.36 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1702  endopeptidase Clp  33.53 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1294  Endopeptidase Clp  36.3 
 
 		 234 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2689  Endopeptidase Clp  32.45 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.53 
 
 		 208 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.81 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3078  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.62 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  33.57 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  34.53 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>