More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1071 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  55.15 
 
 
640 aa  715    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  52.83 
 
 
671 aa  682    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  62.14 
 
 
651 aa  851    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  61.88 
 
 
1156 aa  858    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  55.01 
 
 
668 aa  733    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  51.64 
 
 
667 aa  659    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  55.31 
 
 
669 aa  734    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  62.14 
 
 
651 aa  851    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  75.15 
 
 
689 aa  1106    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  69.98 
 
 
652 aa  965    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  100 
 
 
684 aa  1420    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  100 
 
 
684 aa  1420    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  98.68 
 
 
683 aa  1376    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  48.22 
 
 
656 aa  617  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  41.52 
 
 
620 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  37.98 
 
 
674 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  37.26 
 
 
684 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  30.21 
 
 
688 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  29.28 
 
 
641 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  31.83 
 
 
600 aa  195  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  36.08 
 
 
687 aa  196  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  34.15 
 
 
696 aa  181  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  31.04 
 
 
689 aa  181  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  32.87 
 
 
624 aa  173  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  33.33 
 
 
586 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  39.55 
 
 
361 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  26.7 
 
 
693 aa  154  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  38.3 
 
 
227 aa  148  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  29.43 
 
 
599 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  42.86 
 
 
564 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  42.25 
 
 
258 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  34.95 
 
 
257 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  34.95 
 
 
257 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  36.79 
 
 
251 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  36.79 
 
 
251 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  40.34 
 
 
247 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  37.2 
 
 
251 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  40.85 
 
 
197 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  43.17 
 
 
365 aa  127  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  37.85 
 
 
280 aa  127  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  35.21 
 
 
237 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  33.04 
 
 
381 aa  126  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  37.11 
 
 
282 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  40.35 
 
 
216 aa  125  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  37.04 
 
 
230 aa  124  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  38.07 
 
 
287 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  30 
 
 
612 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  38.89 
 
 
280 aa  118  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  38.89 
 
 
280 aa  118  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  38.37 
 
 
247 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  31.91 
 
 
247 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  45.74 
 
 
247 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  33 
 
 
387 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  36.87 
 
 
248 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  41.21 
 
 
244 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  41.43 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  32.02 
 
 
345 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  37.97 
 
 
280 aa  111  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  36.14 
 
 
280 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  28.18 
 
 
391 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  39.46 
 
 
242 aa  107  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  40.48 
 
 
281 aa  107  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  28.95 
 
 
383 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  37.09 
 
 
229 aa  102  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  37.09 
 
 
229 aa  102  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  36.81 
 
 
284 aa  101  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  27.05 
 
 
351 aa  101  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  29.13 
 
 
780 aa  101  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  38.82 
 
 
279 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  38.24 
 
 
279 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  29.13 
 
 
780 aa  100  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  33.33 
 
 
260 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  35.44 
 
 
243 aa  96.3  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  32.56 
 
 
284 aa  94  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  32.56 
 
 
284 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  30.72 
 
 
234 aa  92  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  33.54 
 
 
260 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  25.29 
 
 
1179 aa  87.8  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  40.31 
 
 
223 aa  86.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  26.4 
 
 
623 aa  86.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  37.32 
 
 
226 aa  84  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  36.36 
 
 
400 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  32.95 
 
 
282 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  38.1 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  38.1 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  35.66 
 
 
210 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  37.98 
 
 
242 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  32.61 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  29.41 
 
 
770 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.42 
 
 
211 aa  77  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2848  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.35 
 
 
208 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0259579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0480  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.58 
 
 
202 aa  76.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  29.59 
 
 
243 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  23.49 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2740  endopeptidase Clp  28.22 
 
 
206 aa  75.1  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600762  decreased coverage  0.00246808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3324  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.25 
 
 
212 aa  75.1  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.09384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  33.08 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6060  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.33 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353257  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1978  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.58 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0100238 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1265  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.06 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>