More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1543 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 281 aa  565  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  61.84 
 
 		 284 aa  336  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  52.81 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  48.59 
 
 		 280 aa  241  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  48.59 
 
 		 280 aa  241  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  48.33 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  47.7 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  49.82 
 
 		 279 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  49.82 
 
 		 279 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  50.59 
 
 		 282 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  49.12 
 
 		 280 aa  224  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  48.72 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  48.09 
 
 		 284 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  47.71 
 
 		 284 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  37.95 
 
 		 668 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  37.95 
 
 		 671 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  37.95 
 
 		 669 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  38.39 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  44.44 
 
 		 651 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  44.44 
 
 		 651 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  38.71 
 
 		 640 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  44.44 
 
 		 1156 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  37.02 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  36.02 
 
 		 242 aa  132  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  41.92 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  42.05 
 
 		 652 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  41.76 
 
 		 689 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  44.03 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  36.99 
 
 		 247 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  36.17 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  36.17 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  41.1 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  40.51 
 
 		 247 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  40.48 
 
 		 684 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  40.48 
 
 		 684 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  40.48 
 
 		 683 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  40.85 
 
 		 620 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  40.61 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  40.25 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  38.51 
 
 		 351 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  45.45 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  38.04 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  33.93 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  40.62 
 
 		 688 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  36.65 
 
 		 674 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  41.57 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  43.92 
 
 		 564 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  36.02 
 
 		 226 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  34.33 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  42.41 
 
 		 684 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  35.48 
 
 		 179 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  34.34 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  34.33 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  29.74 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  29.74 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  33.33 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  38.22 
 
 		 365 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  35.1 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  40.32 
 
 		 197 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  35.22 
 
 		 234 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  33.33 
 
 		 656 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  34.34 
 
 		 667 aa  90.1  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  40 
 
 		 641 aa  89  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  30.19 
 
 		 230 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  34.88 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  36.81 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  32.79 
 
 		 229 aa  85.5  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  32.2 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  30.81 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  37.85 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  34.15 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  35.67 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  35.67 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2151  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.33 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  28.57 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  40.74 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  29.58 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1527  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.25 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.73019  normal  0.314697 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  34.09 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0750  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.92 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0709  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.83 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1265  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.54 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0319  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.33 
 
 		 208 aa  62  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08031  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.26 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819808  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2206  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.25 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2913  Endopeptidase Clp  32.58 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08021  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.61 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  30.41 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0917  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.82 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2565  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.46 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01350  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00166627  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3232  endopeptidase Clp  30.3 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1088  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.33 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.850787  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08421  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.61 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0511  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  31.58 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.1021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1068  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.25 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0752  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  36.5 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.77 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0628  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.69 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1059  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.94 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>