More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3971 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 216 aa  440  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  53.27 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  42.05 
 
 		 671 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  42.05 
 
 		 668 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  42.05 
 
 		 669 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  42.7 
 
 		 640 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  38.02 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  43.45 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  43.75 
 
 		 280 aa  134  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  41.76 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  40.36 
 
 		 651 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  40.36 
 
 		 651 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  40.36 
 
 		 1156 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  42.95 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  39.44 
 
 		 361 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  46.27 
 
 		 620 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  35.59 
 
 		 564 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  39.16 
 
 		 652 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  40.35 
 
 		 684 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  40.35 
 
 		 684 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  41.71 
 
 		 365 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  40.35 
 
 		 683 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  43.12 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  43.12 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  33.93 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  38.12 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  38.15 
 
 		 282 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  37.5 
 
 		 248 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  37.68 
 
 		 282 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  33.82 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  36.88 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  38.39 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  35.03 
 
 		 689 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  34 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  34 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  36.71 
 
 		 383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  35.67 
 
 		 257 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  35.67 
 
 		 257 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  38.15 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  36.92 
 
 		 381 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  30.7 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  33.48 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  40 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  39.18 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  39.62 
 
 		 243 aa  111  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  39.29 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  36.7 
 
 		 351 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  32.83 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  39.16 
 
 		 284 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  33.33 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  34.87 
 
 		 387 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  37.97 
 
 		 684 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  32.32 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  38.36 
 
 		 688 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  43.11 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  33.15 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  43.11 
 
 		 279 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  35.18 
 
 		 667 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  27.59 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  36.02 
 
 		 656 aa  99  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  35.36 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  32.45 
 
 		 674 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  35.15 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  36.43 
 
 		 179 aa  91.7  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  30.88 
 
 		 242 aa  88.6  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  39.37 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  32.54 
 
 		 641 aa  85.9  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  31.87 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  33.78 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  32.48 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  33.95 
 
 		 400 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  31.41 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  36.72 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  36.72 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  38.27 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14387  predicted protein  30.3 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.209543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.54 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  27.94 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.22 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09641  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.14 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.486621  normal  0.137034 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.14 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11730  protease subunit of ATP-dependent protease  31.79 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533928  normal  0.37296 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08441  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.54 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0799239  hitchhiker  0.00187741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.2 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1305  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.47 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  31.47 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3424  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  27.89 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  27.86 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3244  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.41 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0615  Endopeptidase Clp  29.08 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0446476  normal  0.853287 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2956  endopeptidase Clp  30.12 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152745  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1647  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.66 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1385  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.66 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0104132  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0645  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.9 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  29.93 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  29.93 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3642  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  32.33 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.349726  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  29.63 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  30.15 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.98 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>