43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4683 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  100 
 
 		 693 aa  1416    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  40.03 
 
 		 687 aa  432  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  36.31 
 
 		 696 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  34.12 
 
 		 624 aa  333  5e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  35.04 
 
 		 689 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  37.91 
 
 		 600 aa  260  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  29.49 
 
 		 1179 aa  212  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  36.04 
 
 		 599 aa  194  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  34.1 
 
 		 586 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  32.94 
 
 		 684 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  31.84 
 
 		 674 aa  177  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  31.71 
 
 		 669 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  30.82 
 
 		 668 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  30.82 
 
 		 640 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  33.43 
 
 		 641 aa  170  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  31.49 
 
 		 667 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  32.77 
 
 		 652 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  34.44 
 
 		 689 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  29.28 
 
 		 1156 aa  160  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  29.28 
 
 		 651 aa  160  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  32.57 
 
 		 612 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  29.28 
 
 		 651 aa  160  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  30.04 
 
 		 656 aa  157  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  30.08 
 
 		 671 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  32.09 
 
 		 620 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  32.34 
 
 		 684 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  32.34 
 
 		 684 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  32.34 
 
 		 683 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  26.58 
 
 		 623 aa  127  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  26.97 
 
 		 688 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1157  peptidase U35 phage prohead HK97  38.46 
 
 		 286 aa  103  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  26.95 
 
 		 391 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1785  hypothetical protein  25.18 
 
 		 591 aa  80.9  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  25.55 
 
 		 624 aa  73.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  29.74 
 
 		 780 aa  73.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  27.6 
 
 		 382 aa  72  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  25.55 
 
 		 624 aa  72  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  28.72 
 
 		 780 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  24.48 
 
 		 624 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  24.48 
 
 		 624 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1299  peptidase U35, phage prohead HK97  29.12 
 
 		 663 aa  64.3  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  26.4 
 
 		 770 aa  63.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  31.48 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>