63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0411 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  96.63 
 
 		 624 aa  1237    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  95.83 
 
 		 624 aa  1230    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1283    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1283    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1299  peptidase U35, phage prohead HK97  42.29 
 
 		 663 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  28.94 
 
 		 781 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  30.89 
 
 		 416 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  25.92 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  36.33 
 
 		 624 aa  116  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  30.6 
 
 		 1179 aa  102  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  34.91 
 
 		 600 aa  85.1  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  33.33 
 
 		 687 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  29.5 
 
 		 689 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  28.32 
 
 		 382 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  31.12 
 
 		 696 aa  78.2  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1157  peptidase U35 phage prohead HK97  28.99 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  41.1 
 
 		 599 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  38.84 
 
 		 612 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  24.48 
 
 		 693 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  27.53 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  26.4 
 
 		 385 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  26.4 
 
 		 385 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  25.87 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  27.38 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  26.43 
 
 		 279 aa  62  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5508  hypothetical protein  21.99 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  26.22 
 
 		 623 aa  60.1  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  26.96 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  25.34 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  30.07 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  30.07 
 
 		 659 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  24.48 
 
 		 389 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  28.51 
 
 		 431 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1719  HK97 family phage major capsid protein  37.36 
 
 		 429 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  36.88 
 
 		 586 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  26.47 
 
 		 646 aa  53.5  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  34.81 
 
 		 444 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  25.71 
 
 		 390 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3652  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  34.81 
 
 		 393 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  23.95 
 
 		 420 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  31.63 
 
 		 403 aa  51.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0211  hypothetical protein  24.08 
 
 		 386 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  23.73 
 
 		 466 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  28.76 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  0.000000108718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4311  phage major capsid protein, HK97  25.95 
 
 		 285 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.740598 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3878  phage major capsid protein, HK97  25.95 
 
 		 285 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  28.45 
 
 		 386 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  23.93 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3805  phage major capsid protein, HK97  25.95 
 
 		 285 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3765  phage-related major capsid protein  28.02 
 
 		 498 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3714  phage-related major capsid protein  28.02 
 
 		 498 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  25.86 
 
 		 400 aa  47.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  27.45 
 
 		 649 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  23.38 
 
 		 382 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  28.97 
 
 		 384 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  23.38 
 
 		 382 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  26.75 
 
 		 645 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  26.75 
 
 		 645 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  26.75 
 
 		 645 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  22.09 
 
 		 661 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  22.09 
 
 		 661 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  23.81 
 
 		 399 aa  45.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  22.55 
 
 		 403 aa  44.7  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>