44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0734 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  100 
 
 
624 aa  1273    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  38.29 
 
 
696 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  38.2 
 
 
687 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  36.66 
 
 
689 aa  360  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  39.46 
 
 
599 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  34.17 
 
 
693 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  35.25 
 
 
600 aa  325  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  35.98 
 
 
586 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  32.97 
 
 
1179 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  33.84 
 
 
1156 aa  225  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  33.84 
 
 
651 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  33.84 
 
 
651 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  30.73 
 
 
612 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  30.83 
 
 
623 aa  211  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  32.83 
 
 
652 aa  196  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  35.6 
 
 
641 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  32.78 
 
 
674 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  32.87 
 
 
667 aa  181  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  33.61 
 
 
689 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  30.42 
 
 
668 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  30.42 
 
 
640 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  29.91 
 
 
669 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  28.79 
 
 
656 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  33.23 
 
 
683 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  32.94 
 
 
684 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  32.94 
 
 
684 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  29.31 
 
 
620 aa  170  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  29.19 
 
 
684 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  30.82 
 
 
688 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  29.53 
 
 
671 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1157  peptidase U35 phage prohead HK97  42.5 
 
 
286 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206732  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  36.33 
 
 
624 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  36.33 
 
 
624 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  33.72 
 
 
624 aa  109  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  33.72 
 
 
624 aa  109  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1785  hypothetical protein  24.88 
 
 
591 aa  97.4  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  27.73 
 
 
391 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  26.05 
 
 
382 aa  93.2  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1299  peptidase U35, phage prohead HK97  41.18 
 
 
663 aa  91.3  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  25.48 
 
 
780 aa  89.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  24.71 
 
 
780 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  38.39 
 
 
479 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  24.22 
 
 
770 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3411  hypothetical protein  29.01 
 
 
178 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>