31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3411 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3411  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  368  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  37.97 
 
 
780 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  38.82 
 
 
780 aa  124  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  37.82 
 
 
770 aa  101  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  30.98 
 
 
600 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  31.14 
 
 
687 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  28.96 
 
 
684 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  30.94 
 
 
667 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  30.95 
 
 
669 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  30.95 
 
 
668 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  30.95 
 
 
640 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  31.25 
 
 
656 aa  62  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  29.01 
 
 
624 aa  61.2  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  28.49 
 
 
651 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  28.49 
 
 
1156 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  28.49 
 
 
651 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  33.53 
 
 
586 aa  57.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  31.14 
 
 
671 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  29.7 
 
 
674 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  27.65 
 
 
641 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  28.74 
 
 
688 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  27.32 
 
 
620 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  28.42 
 
 
652 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  30.46 
 
 
689 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  30.41 
 
 
599 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  28.42 
 
 
689 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  29.28 
 
 
612 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  25.97 
 
 
683 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  25.41 
 
 
684 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  25.41 
 
 
684 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  25.44 
 
 
696 aa  41.6  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>