45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0807 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  100 
 
 
689 aa  1384    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  36.85 
 
 
687 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  37.07 
 
 
696 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  36.66 
 
 
624 aa  362  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  35.04 
 
 
693 aa  325  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  36.25 
 
 
1179 aa  313  6.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  36.2 
 
 
599 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  34.7 
 
 
586 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  31.89 
 
 
600 aa  259  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  31.39 
 
 
612 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  36.16 
 
 
674 aa  209  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  33.74 
 
 
1156 aa  201  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  33.74 
 
 
651 aa  201  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  33.74 
 
 
651 aa  201  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  33.24 
 
 
641 aa  200  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  35.01 
 
 
684 aa  200  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  32.72 
 
 
652 aa  194  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  33.99 
 
 
688 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  35.25 
 
 
667 aa  185  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  32.19 
 
 
640 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  32.19 
 
 
668 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  36.14 
 
 
684 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  36.14 
 
 
684 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  30.27 
 
 
683 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  35.69 
 
 
669 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  35.57 
 
 
620 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  31.97 
 
 
656 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  31.33 
 
 
671 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  34.97 
 
 
689 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  28.13 
 
 
623 aa  144  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  30.64 
 
 
391 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1785  hypothetical protein  28 
 
 
591 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1157  peptidase U35 phage prohead HK97  41.03 
 
 
286 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206732  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  32.81 
 
 
780 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  31.18 
 
 
624 aa  86.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  31.4 
 
 
624 aa  85.5  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  32.03 
 
 
780 aa  84.7  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1299  peptidase U35, phage prohead HK97  36.26 
 
 
663 aa  82  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  29.5 
 
 
624 aa  79.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  29.5 
 
 
624 aa  79.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  27.27 
 
 
770 aa  79  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  27.1 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  33.33 
 
 
479 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3411  hypothetical protein  30.46 
 
 
178 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1962  major head subunit protein  26.49 
 
 
299 aa  45.8  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.248362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>