38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4104 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  46.77 
 
 		 770 aa  663    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  97.31 
 
 		 780 aa  1518    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  100 
 
 		 780 aa  1590    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3410  hypothetical protein  25.48 
 
 		 601 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3411  hypothetical protein  38.82 
 
 		 178 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  29.72 
 
 		 586 aa  124  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  30.24 
 
 		 600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  34.35 
 
 		 651 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  34.35 
 
 		 651 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  34.35 
 
 		 1156 aa  115  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  29.97 
 
 		 684 aa  114  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  30.43 
 
 		 641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  30.68 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  29.74 
 
 		 688 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  31.58 
 
 		 656 aa  104  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  29.13 
 
 		 684 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  29.13 
 
 		 684 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  28.38 
 
 		 667 aa  100  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  29.13 
 
 		 683 aa  99.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  28.76 
 
 		 620 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  29.51 
 
 		 687 aa  95.1  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  27.69 
 
 		 669 aa  94.7  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  27.39 
 
 		 640 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  27.39 
 
 		 668 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  30.57 
 
 		 652 aa  92  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  28.48 
 
 		 689 aa  91.3  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  27.07 
 
 		 671 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  25.48 
 
 		 624 aa  89.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  29.87 
 
 		 391 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  27.78 
 
 		 599 aa  87.8  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  32.03 
 
 		 689 aa  85.1  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  27.21 
 
 		 696 aa  84.7  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  27.91 
 
 		 674 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  28.72 
 
 		 693 aa  70.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  27.47 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  23.15 
 
 		 1179 aa  62.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  25.96 
 
 		 623 aa  51.6  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1785  hypothetical protein  28.4 
 
 		 591 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>