127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3337 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  73.29 
 
 		 587 aa  848    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  100 
 
 		 1179 aa  2416    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  61.44 
 
 		 592 aa  696    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  62.86 
 
 		 593 aa  749    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  67.44 
 
 		 605 aa  796    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  37.8 
 
 		 696 aa  366  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  36.25 
 
 		 689 aa  313  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  34.55 
 
 		 665 aa  301  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  34.25 
 
 		 687 aa  301  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  34.09 
 
 		 618 aa  299  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  33.92 
 
 		 618 aa  298  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  33.74 
 
 		 618 aa  297  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  33.51 
 
 		 618 aa  296  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  33.86 
 
 		 618 aa  295  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  33.16 
 
 		 618 aa  285  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  33.1 
 
 		 618 aa  281  7e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  32.97 
 
 		 624 aa  260  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  30.43 
 
 		 650 aa  260  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  33.18 
 
 		 599 aa  259  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  31.31 
 
 		 650 aa  258  5e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  31.31 
 
 		 650 aa  258  5e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  31.6 
 
 		 616 aa  258  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  31.49 
 
 		 650 aa  257  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  31 
 
 		 604 aa  246  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  29.66 
 
 		 656 aa  244  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  31.95 
 
 		 693 aa  238  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  30.02 
 
 		 651 aa  237  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  29.88 
 
 		 660 aa  234  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  29.51 
 
 		 608 aa  232  4e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  31.3 
 
 		 626 aa  229  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  30.76 
 
 		 586 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  30.21 
 
 		 614 aa  220  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  31.5 
 
 		 678 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  31.02 
 
 		 674 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  29.44 
 
 		 614 aa  219  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  30.76 
 
 		 680 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  28.79 
 
 		 607 aa  216  1.9999999999999998e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  28.55 
 
 		 708 aa  213  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  29.49 
 
 		 693 aa  211  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  29.6 
 
 		 600 aa  210  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  29.44 
 
 		 675 aa  207  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  27.8 
 
 		 662 aa  196  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  28.24 
 
 		 642 aa  193  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  28.52 
 
 		 642 aa  190  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  27.65 
 
 		 639 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  29.08 
 
 		 684 aa  185  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  28.91 
 
 		 643 aa  177  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  29.75 
 
 		 623 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  27.52 
 
 		 641 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  26.48 
 
 		 725 aa  174  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  25.82 
 
 		 692 aa  171  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  25.62 
 
 		 692 aa  171  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  25.62 
 
 		 689 aa  170  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  26.53 
 
 		 641 aa  169  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  26.7 
 
 		 641 aa  168  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  26.7 
 
 		 641 aa  168  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  26.7 
 
 		 641 aa  168  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  26.53 
 
 		 641 aa  167  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  26.28 
 
 		 677 aa  166  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  25.96 
 
 		 698 aa  166  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  28.01 
 
 		 612 aa  161  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1157  peptidase U35 phage prohead HK97  40.75 
 
 		 286 aa  159  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  25.76 
 
 		 654 aa  159  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  32.88 
 
 		 641 aa  152  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  26.04 
 
 		 529 aa  152  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  25.3 
 
 		 635 aa  150  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  26.29 
 
 		 660 aa  145  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  26.42 
 
 		 634 aa  140  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  26.37 
 
 		 665 aa  139  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  26.37 
 
 		 665 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  24.67 
 
 		 725 aa  137  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  26.37 
 
 		 665 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  26.2 
 
 		 665 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  23.66 
 
 		 680 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  28.05 
 
 		 684 aa  127  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  27.14 
 
 		 1156 aa  125  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  25.45 
 
 		 688 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  27.14 
 
 		 651 aa  124  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  27.14 
 
 		 651 aa  124  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  30.23 
 
 		 391 aa  116  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  26.41 
 
 		 671 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  24.39 
 
 		 641 aa  112  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  27.59 
 
 		 667 aa  109  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  24.95 
 
 		 699 aa  108  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  27.22 
 
 		 674 aa  106  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  24.93 
 
 		 669 aa  107  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  24.34 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  24.34 
 
 		 668 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  30.32 
 
 		 624 aa  103  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  30.32 
 
 		 624 aa  102  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  30.6 
 
 		 624 aa  102  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  30.6 
 
 		 624 aa  102  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  25.05 
 
 		 656 aa  100  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  23.65 
 
 		 711 aa  96.3  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  26.33 
 
 		 382 aa  89  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  25.95 
 
 		 620 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  25.31 
 
 		 684 aa  87  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  25.31 
 
 		 684 aa  87  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  25.93 
 
 		 683 aa  87  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  23.34 
 
 		 720 aa  86.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>