87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2748 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  82.52 
 
 		 618 aa  1066    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  94.82 
 
 		 618 aa  1212    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  98.06 
 
 		 618 aa  1257    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  94.82 
 
 		 618 aa  1219    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  82.52 
 
 		 618 aa  1065    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  97.73 
 
 		 618 aa  1251    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  100 
 
 		 618 aa  1274    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  50.86 
 
 		 608 aa  542  1e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  50.09 
 
 		 607 aa  544  1e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  49.57 
 
 		 660 aa  519  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  46.9 
 
 		 651 aa  521  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  49.05 
 
 		 656 aa  515  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  45.45 
 
 		 626 aa  487  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  44.82 
 
 		 614 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  44.81 
 
 		 614 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  40.98 
 
 		 665 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  41.13 
 
 		 616 aa  438  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  42.5 
 
 		 678 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  42.11 
 
 		 604 aa  425  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  40.58 
 
 		 674 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  41.25 
 
 		 680 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  39.79 
 
 		 650 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  36.21 
 
 		 708 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  36.57 
 
 		 675 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  40.07 
 
 		 650 aa  360  5e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  40.07 
 
 		 650 aa  360  5e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  39.9 
 
 		 650 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  35.33 
 
 		 684 aa  343  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  37.21 
 
 		 693 aa  339  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  36.79 
 
 		 592 aa  332  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  35.46 
 
 		 593 aa  332  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  33.44 
 
 		 725 aa  318  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  33.5 
 
 		 605 aa  306  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  34.8 
 
 		 587 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  33.44 
 
 		 692 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  33.74 
 
 		 1179 aa  289  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  33.22 
 
 		 689 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  33.82 
 
 		 692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  32.21 
 
 		 720 aa  250  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  31.6 
 
 		 662 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  32.23 
 
 		 639 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  30.43 
 
 		 634 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  32.42 
 
 		 677 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  30.81 
 
 		 642 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  30.86 
 
 		 642 aa  231  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  30.53 
 
 		 665 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  30.91 
 
 		 665 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  30.49 
 
 		 665 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  30.83 
 
 		 660 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  30.34 
 
 		 665 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  31.71 
 
 		 641 aa  220  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  28.96 
 
 		 725 aa  220  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  30.87 
 
 		 641 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  30.87 
 
 		 641 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  30.87 
 
 		 641 aa  219  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  30.71 
 
 		 641 aa  218  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  30.81 
 
 		 641 aa  217  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  29.59 
 
 		 643 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  28.34 
 
 		 699 aa  211  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  28.94 
 
 		 698 aa  200  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  29.62 
 
 		 635 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  28.14 
 
 		 711 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  28.71 
 
 		 654 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  28.81 
 
 		 680 aa  192  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  29.3 
 
 		 713 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  28.01 
 
 		 713 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  28.01 
 
 		 713 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  29.07 
 
 		 707 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  29.07 
 
 		 707 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  29.07 
 
 		 707 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  26.11 
 
 		 671 aa  171  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  28.46 
 
 		 529 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  28.85 
 
 		 700 aa  160  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  28.32 
 
 		 709 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  28.09 
 
 		 641 aa  157  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  26.48 
 
 		 692 aa  143  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  27.55 
 
 		 700 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  25.75 
 
 		 685 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  26.09 
 
 		 690 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  25.78 
 
 		 697 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3430  terminase GpA  24.96 
 
 		 748 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  25.11 
 
 		 720 aa  106  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  24.96 
 
 		 720 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1355  Bacteriophage tail assembly protein-like protein  21.59 
 
 		 565 aa  62  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00357201  hitchhiker  0.000000000207538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6670  hypothetical protein  28.57 
 
 		 330 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03899  product of A truncated bacteriophage gene protein  70.45 
 
 		 97 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.670346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38583  predicted protein  25 
 
 		 754 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449683  normal  0.114344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>